Protein–RNA interactions for Protein: Q53FZ2

ACSM3, Acyl-coenzyme A synthetase ACSM3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSM3Q53FZ2 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACSM3Q53FZ2 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACSM3Q53FZ2 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACSM3Q53FZ2 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACSM3Q53FZ2 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACSM3Q53FZ2 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACSM3Q53FZ2 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACSM3Q53FZ2 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACSM3Q53FZ2 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACSM3Q53FZ2 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACSM3Q53FZ2 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACSM3Q53FZ2 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACSM3Q53FZ2 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACSM3Q53FZ2 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACSM3Q53FZ2 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACSM3Q53FZ2 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACSM3Q53FZ2 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACSM3Q53FZ2 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACSM3Q53FZ2 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACSM3Q53FZ2 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ACSM3Q53FZ2 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACSM3Q53FZ2 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACSM3Q53FZ2 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACSM3Q53FZ2 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ACSM3Q53FZ2 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACSM3Q53FZ2 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ACSM3Q53FZ2 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ACSM3Q53FZ2 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACSM3Q53FZ2 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ACSM3Q53FZ2 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ACSM3Q53FZ2 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ACSM3Q53FZ2 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
ACSM3Q53FZ2 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ACSM3Q53FZ2 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ACSM3Q53FZ2 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ACSM3Q53FZ2 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ACSM3Q53FZ2 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ACSM3Q53FZ2 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ACSM3Q53FZ2 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ACSM3Q53FZ2 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ACSM3Q53FZ2 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ACSM3Q53FZ2 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ACSM3Q53FZ2 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ACSM3Q53FZ2 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ACSM3Q53FZ2 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACSM3Q53FZ2 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACSM3Q53FZ2 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACSM3Q53FZ2 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACSM3Q53FZ2 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACSM3Q53FZ2 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACSM3Q53FZ2 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACSM3Q53FZ2 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACSM3Q53FZ2 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACSM3Q53FZ2 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACSM3Q53FZ2 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACSM3Q53FZ2 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACSM3Q53FZ2 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACSM3Q53FZ2 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ACSM3Q53FZ2 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACSM3Q53FZ2 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACSM3Q53FZ2 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ACSM3Q53FZ2 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACSM3Q53FZ2 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ACSM3Q53FZ2 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACSM3Q53FZ2 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACSM3Q53FZ2 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACSM3Q53FZ2 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACSM3Q53FZ2 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACSM3Q53FZ2 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACSM3Q53FZ2 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACSM3Q53FZ2 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACSM3Q53FZ2 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACSM3Q53FZ2 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACSM3Q53FZ2 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACSM3Q53FZ2 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACSM3Q53FZ2 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACSM3Q53FZ2 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACSM3Q53FZ2 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACSM3Q53FZ2 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACSM3Q53FZ2 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ACSM3Q53FZ2 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACSM3Q53FZ2 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACSM3Q53FZ2 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACSM3Q53FZ2 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACSM3Q53FZ2 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACSM3Q53FZ2 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACSM3Q53FZ2 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACSM3Q53FZ2 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACSM3Q53FZ2 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACSM3Q53FZ2 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACSM3Q53FZ2 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACSM3Q53FZ2 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACSM3Q53FZ2 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACSM3Q53FZ2 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACSM3Q53FZ2 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACSM3Q53FZ2 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACSM3Q53FZ2 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACSM3Q53FZ2 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACSM3Q53FZ2 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACSM3Q53FZ2 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.8 ms