Protein–RNA interactions for Protein: Q29983

MICA, MHC class I polypeptide-related sequence A, humanhuman

Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MICAQ29983 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MICAQ29983 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MICAQ29983 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MICAQ29983 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MICAQ29983 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MICAQ29983 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MICAQ29983 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MICAQ29983 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MICAQ29983 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MICAQ29983 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MICAQ29983 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MICAQ29983 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MICAQ29983 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MICAQ29983 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MICAQ29983 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MICAQ29983 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
MICAQ29983 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MICAQ29983 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MICAQ29983 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MICAQ29983 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MICAQ29983 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MICAQ29983 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MICAQ29983 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MICAQ29983 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
MICAQ29983 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
MICAQ29983 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
MICAQ29983 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MICAQ29983 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MICAQ29983 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MICAQ29983 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MICAQ29983 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MICAQ29983 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MICAQ29983 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MICAQ29983 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MICAQ29983 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MICAQ29983 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MICAQ29983 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
MICAQ29983 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
MICAQ29983 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MICAQ29983 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MICAQ29983 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MICAQ29983 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MICAQ29983 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MICAQ29983 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MICAQ29983 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MICAQ29983 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MICAQ29983 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MICAQ29983 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MICAQ29983 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MICAQ29983 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MICAQ29983 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MICAQ29983 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MICAQ29983 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MICAQ29983 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MICAQ29983 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MICAQ29983 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MICAQ29983 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MICAQ29983 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MICAQ29983 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MICAQ29983 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MICAQ29983 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MICAQ29983 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MICAQ29983 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MICAQ29983 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
MICAQ29983 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MICAQ29983 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MICAQ29983 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MICAQ29983 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MICAQ29983 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MICAQ29983 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MICAQ29983 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MICAQ29983 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MICAQ29983 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MICAQ29983 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MICAQ29983 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MICAQ29983 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MICAQ29983 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MICAQ29983 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MICAQ29983 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
MICAQ29983 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MICAQ29983 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MICAQ29983 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MICAQ29983 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MICAQ29983 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MICAQ29983 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MICAQ29983 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MICAQ29983 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MICAQ29983 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MICAQ29983 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MICAQ29983 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MICAQ29983 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MICAQ29983 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MICAQ29983 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MICAQ29983 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MICAQ29983 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MICAQ29983 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MICAQ29983 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MICAQ29983 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MICAQ29983 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MICAQ29983 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms