Protein–RNA interactions for Protein: Q1L6U9

MSMP, Prostate-associated microseminoprotein, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSMPQ1L6U9 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MSMPQ1L6U9 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MSMPQ1L6U9 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MSMPQ1L6U9 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MSMPQ1L6U9 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MSMPQ1L6U9 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
MSMPQ1L6U9 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MSMPQ1L6U9 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MSMPQ1L6U9 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MSMPQ1L6U9 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MSMPQ1L6U9 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MSMPQ1L6U9 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MSMPQ1L6U9 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MSMPQ1L6U9 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MSMPQ1L6U9 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MSMPQ1L6U9 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MSMPQ1L6U9 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MSMPQ1L6U9 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MSMPQ1L6U9 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MSMPQ1L6U9 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MSMPQ1L6U9 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MSMPQ1L6U9 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MSMPQ1L6U9 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MSMPQ1L6U9 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MSMPQ1L6U9 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MSMPQ1L6U9 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MSMPQ1L6U9 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MSMPQ1L6U9 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
MSMPQ1L6U9 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MSMPQ1L6U9 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MSMPQ1L6U9 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MSMPQ1L6U9 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MSMPQ1L6U9 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MSMPQ1L6U9 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MSMPQ1L6U9 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MSMPQ1L6U9 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MSMPQ1L6U9 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MSMPQ1L6U9 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MSMPQ1L6U9 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MSMPQ1L6U9 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MSMPQ1L6U9 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MSMPQ1L6U9 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MSMPQ1L6U9 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MSMPQ1L6U9 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MSMPQ1L6U9 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MSMPQ1L6U9 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MSMPQ1L6U9 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MSMPQ1L6U9 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MSMPQ1L6U9 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MSMPQ1L6U9 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MSMPQ1L6U9 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MSMPQ1L6U9 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MSMPQ1L6U9 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MSMPQ1L6U9 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MSMPQ1L6U9 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MSMPQ1L6U9 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MSMPQ1L6U9 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MSMPQ1L6U9 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MSMPQ1L6U9 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
MSMPQ1L6U9 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MSMPQ1L6U9 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MSMPQ1L6U9 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MSMPQ1L6U9 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MSMPQ1L6U9 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MSMPQ1L6U9 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
MSMPQ1L6U9 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
MSMPQ1L6U9 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
MSMPQ1L6U9 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
MSMPQ1L6U9 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
MSMPQ1L6U9 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
MSMPQ1L6U9 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
MSMPQ1L6U9 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
MSMPQ1L6U9 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
MSMPQ1L6U9 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MSMPQ1L6U9 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MSMPQ1L6U9 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MSMPQ1L6U9 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MSMPQ1L6U9 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MSMPQ1L6U9 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MSMPQ1L6U9 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MSMPQ1L6U9 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MSMPQ1L6U9 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MSMPQ1L6U9 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MSMPQ1L6U9 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MSMPQ1L6U9 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MSMPQ1L6U9 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MSMPQ1L6U9 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MSMPQ1L6U9 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MSMPQ1L6U9 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MSMPQ1L6U9 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MSMPQ1L6U9 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MSMPQ1L6U9 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MSMPQ1L6U9 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MSMPQ1L6U9 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MSMPQ1L6U9 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MSMPQ1L6U9 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
MSMPQ1L6U9 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
MSMPQ1L6U9 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MSMPQ1L6U9 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MSMPQ1L6U9 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms