Protein–RNA interactions for Protein: Q16881

TXNRD1, Thioredoxin reductase 1, cytoplasmic, humanhuman

Predictions only

Length 649 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TXNRD1Q16881 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TXNRD1Q16881 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TXNRD1Q16881 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TXNRD1Q16881 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TXNRD1Q16881 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TXNRD1Q16881 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TXNRD1Q16881 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
TXNRD1Q16881 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TXNRD1Q16881 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TXNRD1Q16881 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TXNRD1Q16881 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TXNRD1Q16881 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TXNRD1Q16881 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TXNRD1Q16881 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TXNRD1Q16881 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TXNRD1Q16881 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
TXNRD1Q16881 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TXNRD1Q16881 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TXNRD1Q16881 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TXNRD1Q16881 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TXNRD1Q16881 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TXNRD1Q16881 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TXNRD1Q16881 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TXNRD1Q16881 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TXNRD1Q16881 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TXNRD1Q16881 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TXNRD1Q16881 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TXNRD1Q16881 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TXNRD1Q16881 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TXNRD1Q16881 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TXNRD1Q16881 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TXNRD1Q16881 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TXNRD1Q16881 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TXNRD1Q16881 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
TXNRD1Q16881 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TXNRD1Q16881 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TXNRD1Q16881 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TXNRD1Q16881 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TXNRD1Q16881 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
TXNRD1Q16881 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TXNRD1Q16881 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TXNRD1Q16881 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TXNRD1Q16881 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TXNRD1Q16881 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TXNRD1Q16881 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TXNRD1Q16881 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
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TXNRD1Q16881 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
TXNRD1Q16881 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TXNRD1Q16881 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TXNRD1Q16881 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
TXNRD1Q16881 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TXNRD1Q16881 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TXNRD1Q16881 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TXNRD1Q16881 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TXNRD1Q16881 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TXNRD1Q16881 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TXNRD1Q16881 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TXNRD1Q16881 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TXNRD1Q16881 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TXNRD1Q16881 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TXNRD1Q16881 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TXNRD1Q16881 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TXNRD1Q16881 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TXNRD1Q16881 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TXNRD1Q16881 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TXNRD1Q16881 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TXNRD1Q16881 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TXNRD1Q16881 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TXNRD1Q16881 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TXNRD1Q16881 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
TXNRD1Q16881 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TXNRD1Q16881 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
TXNRD1Q16881 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TXNRD1Q16881 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TXNRD1Q16881 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TXNRD1Q16881 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TXNRD1Q16881 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TXNRD1Q16881 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TXNRD1Q16881 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TXNRD1Q16881 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TXNRD1Q16881 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
TXNRD1Q16881 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
TXNRD1Q16881 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TXNRD1Q16881 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TXNRD1Q16881 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TXNRD1Q16881 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TXNRD1Q16881 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TXNRD1Q16881 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TXNRD1Q16881 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TXNRD1Q16881 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
TXNRD1Q16881 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TXNRD1Q16881 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TXNRD1Q16881 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TXNRD1Q16881 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TXNRD1Q16881 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TXNRD1Q16881 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TXNRD1Q16881 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TXNRD1Q16881 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TXNRD1Q16881 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
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