Protein–RNA interactions for Protein: Q16827

PTPRO, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, humanhuman

Predictions only

Length 1,216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPROQ16827 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTPROQ16827 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTPROQ16827 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTPROQ16827 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTPROQ16827 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTPROQ16827 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTPROQ16827 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTPROQ16827 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTPROQ16827 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTPROQ16827 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
PTPROQ16827 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTPROQ16827 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTPROQ16827 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTPROQ16827 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTPROQ16827 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTPROQ16827 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTPROQ16827 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
PTPROQ16827 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTPROQ16827 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTPROQ16827 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTPROQ16827 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTPROQ16827 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTPROQ16827 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTPROQ16827 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTPROQ16827 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTPROQ16827 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTPROQ16827 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTPROQ16827 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTPROQ16827 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
PTPROQ16827 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTPROQ16827 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTPROQ16827 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTPROQ16827 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTPROQ16827 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTPROQ16827 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTPROQ16827 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTPROQ16827 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTPROQ16827 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTPROQ16827 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTPROQ16827 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
PTPROQ16827 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
PTPROQ16827 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTPROQ16827 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTPROQ16827 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC19.84■□□□□ 0.77
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PTPROQ16827 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
PTPROQ16827 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTPROQ16827 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTPROQ16827 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTPROQ16827 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTPROQ16827 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTPROQ16827 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTPROQ16827 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTPROQ16827 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTPROQ16827 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTPROQ16827 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
PTPROQ16827 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
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PTPROQ16827 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTPROQ16827 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTPROQ16827 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTPROQ16827 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTPROQ16827 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTPROQ16827 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTPROQ16827 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PTPROQ16827 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PTPROQ16827 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PTPROQ16827 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PTPROQ16827 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PTPROQ16827 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PTPROQ16827 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PTPROQ16827 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PTPROQ16827 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
PTPROQ16827 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PTPROQ16827 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
PTPROQ16827 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PTPROQ16827 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PTPROQ16827 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
PTPROQ16827 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PTPROQ16827 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PTPROQ16827 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
PTPROQ16827 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
PTPROQ16827 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PTPROQ16827 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
PTPROQ16827 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
PTPROQ16827 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
PTPROQ16827 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
PTPROQ16827 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
PTPROQ16827 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.76
PTPROQ16827 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
PTPROQ16827 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
PTPROQ16827 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PTPROQ16827 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PTPROQ16827 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PTPROQ16827 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PTPROQ16827 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PTPROQ16827 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PTPROQ16827 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PTPROQ16827 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
PTPROQ16827 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
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