Protein–RNA interactions for Protein: Q16534

HLF, Hepatic leukemia factor, humanhuman

Predictions only

Length 295 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLFQ16534 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HLFQ16534 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HLFQ16534 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HLFQ16534 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
HLFQ16534 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HLFQ16534 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
HLFQ16534 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HLFQ16534 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HLFQ16534 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HLFQ16534 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
HLFQ16534 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
HLFQ16534 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
HLFQ16534 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HLFQ16534 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HLFQ16534 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HLFQ16534 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HLFQ16534 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HLFQ16534 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HLFQ16534 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HLFQ16534 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
HLFQ16534 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HLFQ16534 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HLFQ16534 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HLFQ16534 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HLFQ16534 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HLFQ16534 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HLFQ16534 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
HLFQ16534 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
HLFQ16534 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HLFQ16534 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HLFQ16534 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HLFQ16534 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HLFQ16534 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HLFQ16534 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
HLFQ16534 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HLFQ16534 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HLFQ16534 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HLFQ16534 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HLFQ16534 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HLFQ16534 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HLFQ16534 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HLFQ16534 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HLFQ16534 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HLFQ16534 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HLFQ16534 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HLFQ16534 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HLFQ16534 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HLFQ16534 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HLFQ16534 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HLFQ16534 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HLFQ16534 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HLFQ16534 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HLFQ16534 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
HLFQ16534 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HLFQ16534 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HLFQ16534 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HLFQ16534 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HLFQ16534 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HLFQ16534 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HLFQ16534 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
HLFQ16534 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HLFQ16534 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HLFQ16534 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HLFQ16534 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HLFQ16534 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HLFQ16534 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HLFQ16534 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HLFQ16534 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HLFQ16534 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HLFQ16534 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HLFQ16534 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HLFQ16534 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HLFQ16534 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HLFQ16534 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HLFQ16534 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HLFQ16534 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HLFQ16534 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HLFQ16534 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HLFQ16534 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HLFQ16534 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HLFQ16534 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HLFQ16534 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HLFQ16534 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HLFQ16534 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
HLFQ16534 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HLFQ16534 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HLFQ16534 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HLFQ16534 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HLFQ16534 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HLFQ16534 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HLFQ16534 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HLFQ16534 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HLFQ16534 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HLFQ16534 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HLFQ16534 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HLFQ16534 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HLFQ16534 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HLFQ16534 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HLFQ16534 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HLFQ16534 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms