Protein–RNA interactions for Protein: Q15270

NKX1-1, NK1 transcription factor-related protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX1-1Q15270 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NKX1-1Q15270 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NKX1-1Q15270 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NKX1-1Q15270 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NKX1-1Q15270 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NKX1-1Q15270 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NKX1-1Q15270 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NKX1-1Q15270 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NKX1-1Q15270 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NKX1-1Q15270 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NKX1-1Q15270 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NKX1-1Q15270 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NKX1-1Q15270 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NKX1-1Q15270 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NKX1-1Q15270 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NKX1-1Q15270 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NKX1-1Q15270 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NKX1-1Q15270 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
NKX1-1Q15270 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
NKX1-1Q15270 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NKX1-1Q15270 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NKX1-1Q15270 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NKX1-1Q15270 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
NKX1-1Q15270 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NKX1-1Q15270 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NKX1-1Q15270 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NKX1-1Q15270 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NKX1-1Q15270 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
NKX1-1Q15270 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NKX1-1Q15270 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NKX1-1Q15270 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NKX1-1Q15270 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NKX1-1Q15270 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NKX1-1Q15270 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NKX1-1Q15270 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NKX1-1Q15270 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NKX1-1Q15270 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NKX1-1Q15270 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
NKX1-1Q15270 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
NKX1-1Q15270 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NKX1-1Q15270 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
NKX1-1Q15270 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NKX1-1Q15270 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NKX1-1Q15270 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
NKX1-1Q15270 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
NKX1-1Q15270 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NKX1-1Q15270 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NKX1-1Q15270 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NKX1-1Q15270 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NKX1-1Q15270 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NKX1-1Q15270 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NKX1-1Q15270 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NKX1-1Q15270 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NKX1-1Q15270 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NKX1-1Q15270 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NKX1-1Q15270 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NKX1-1Q15270 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NKX1-1Q15270 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NKX1-1Q15270 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NKX1-1Q15270 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NKX1-1Q15270 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NKX1-1Q15270 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NKX1-1Q15270 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NKX1-1Q15270 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NKX1-1Q15270 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NKX1-1Q15270 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NKX1-1Q15270 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NKX1-1Q15270 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NKX1-1Q15270 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NKX1-1Q15270 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NKX1-1Q15270 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NKX1-1Q15270 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NKX1-1Q15270 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NKX1-1Q15270 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NKX1-1Q15270 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NKX1-1Q15270 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
NKX1-1Q15270 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NKX1-1Q15270 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
NKX1-1Q15270 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
NKX1-1Q15270 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
NKX1-1Q15270 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
NKX1-1Q15270 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
NKX1-1Q15270 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NKX1-1Q15270 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NKX1-1Q15270 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NKX1-1Q15270 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
NKX1-1Q15270 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NKX1-1Q15270 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NKX1-1Q15270 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
NKX1-1Q15270 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
NKX1-1Q15270 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NKX1-1Q15270 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NKX1-1Q15270 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NKX1-1Q15270 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NKX1-1Q15270 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NKX1-1Q15270 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NKX1-1Q15270 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NKX1-1Q15270 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NKX1-1Q15270 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NKX1-1Q15270 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
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