Protein–RNA interactions for Protein: Q15113

PCOLCE, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, humanhuman

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Length 449 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCOLCEQ15113 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PCOLCEQ15113 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PCOLCEQ15113 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PCOLCEQ15113 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PCOLCEQ15113 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PCOLCEQ15113 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
PCOLCEQ15113 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PCOLCEQ15113 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PCOLCEQ15113 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PCOLCEQ15113 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PCOLCEQ15113 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PCOLCEQ15113 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PCOLCEQ15113 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PCOLCEQ15113 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PCOLCEQ15113 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PCOLCEQ15113 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PCOLCEQ15113 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PCOLCEQ15113 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PCOLCEQ15113 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PCOLCEQ15113 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
PCOLCEQ15113 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PCOLCEQ15113 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
PCOLCEQ15113 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
PCOLCEQ15113 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PCOLCEQ15113 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PCOLCEQ15113 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PCOLCEQ15113 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PCOLCEQ15113 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PCOLCEQ15113 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
PCOLCEQ15113 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
PCOLCEQ15113 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PCOLCEQ15113 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PCOLCEQ15113 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PCOLCEQ15113 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PCOLCEQ15113 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PCOLCEQ15113 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PCOLCEQ15113 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PCOLCEQ15113 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PCOLCEQ15113 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PCOLCEQ15113 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PCOLCEQ15113 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PCOLCEQ15113 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PCOLCEQ15113 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PCOLCEQ15113 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PCOLCEQ15113 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PCOLCEQ15113 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PCOLCEQ15113 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PCOLCEQ15113 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PCOLCEQ15113 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PCOLCEQ15113 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PCOLCEQ15113 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PCOLCEQ15113 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PCOLCEQ15113 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PCOLCEQ15113 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PCOLCEQ15113 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PCOLCEQ15113 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PCOLCEQ15113 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
PCOLCEQ15113 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
PCOLCEQ15113 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PCOLCEQ15113 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
PCOLCEQ15113 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
PCOLCEQ15113 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
PCOLCEQ15113 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PCOLCEQ15113 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
PCOLCEQ15113 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PCOLCEQ15113 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PCOLCEQ15113 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PCOLCEQ15113 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PCOLCEQ15113 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PCOLCEQ15113 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PCOLCEQ15113 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PCOLCEQ15113 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PCOLCEQ15113 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
PCOLCEQ15113 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
PCOLCEQ15113 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
PCOLCEQ15113 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
PCOLCEQ15113 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
PCOLCEQ15113 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PCOLCEQ15113 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PCOLCEQ15113 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PCOLCEQ15113 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PCOLCEQ15113 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PCOLCEQ15113 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PCOLCEQ15113 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PCOLCEQ15113 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PCOLCEQ15113 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PCOLCEQ15113 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PCOLCEQ15113 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PCOLCEQ15113 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PCOLCEQ15113 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PCOLCEQ15113 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PCOLCEQ15113 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PCOLCEQ15113 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PCOLCEQ15113 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PCOLCEQ15113 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PCOLCEQ15113 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PCOLCEQ15113 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PCOLCEQ15113 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PCOLCEQ15113 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PCOLCEQ15113 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
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