Protein–RNA interactions for Protein: Q14714

SSPN, Sarcospan, humanhuman

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Length 243 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSPNQ14714 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SSPNQ14714 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SSPNQ14714 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SSPNQ14714 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SSPNQ14714 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SSPNQ14714 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SSPNQ14714 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SSPNQ14714 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SSPNQ14714 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SSPNQ14714 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SSPNQ14714 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SSPNQ14714 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SSPNQ14714 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SSPNQ14714 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SSPNQ14714 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SSPNQ14714 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SSPNQ14714 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SSPNQ14714 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SSPNQ14714 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SSPNQ14714 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SSPNQ14714 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SSPNQ14714 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SSPNQ14714 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SSPNQ14714 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SSPNQ14714 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SSPNQ14714 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SSPNQ14714 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SSPNQ14714 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SSPNQ14714 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SSPNQ14714 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SSPNQ14714 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SSPNQ14714 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SSPNQ14714 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SSPNQ14714 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SSPNQ14714 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SSPNQ14714 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SSPNQ14714 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SSPNQ14714 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SSPNQ14714 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SSPNQ14714 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SSPNQ14714 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SSPNQ14714 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SSPNQ14714 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SSPNQ14714 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SSPNQ14714 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SSPNQ14714 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SSPNQ14714 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SSPNQ14714 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SSPNQ14714 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SSPNQ14714 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SSPNQ14714 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SSPNQ14714 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SSPNQ14714 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SSPNQ14714 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SSPNQ14714 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SSPNQ14714 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SSPNQ14714 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SSPNQ14714 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SSPNQ14714 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SSPNQ14714 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SSPNQ14714 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SSPNQ14714 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SSPNQ14714 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SSPNQ14714 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SSPNQ14714 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SSPNQ14714 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SSPNQ14714 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SSPNQ14714 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SSPNQ14714 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SSPNQ14714 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SSPNQ14714 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SSPNQ14714 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SSPNQ14714 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SSPNQ14714 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SSPNQ14714 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SSPNQ14714 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SSPNQ14714 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SSPNQ14714 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SSPNQ14714 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SSPNQ14714 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SSPNQ14714 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SSPNQ14714 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SSPNQ14714 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SSPNQ14714 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SSPNQ14714 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SSPNQ14714 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SSPNQ14714 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SSPNQ14714 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SSPNQ14714 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SSPNQ14714 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SSPNQ14714 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SSPNQ14714 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SSPNQ14714 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SSPNQ14714 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SSPNQ14714 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SSPNQ14714 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SSPNQ14714 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SSPNQ14714 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SSPNQ14714 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SSPNQ14714 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
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