Protein–RNA interactions for Protein: Q14684

RRP1B, Ribosomal RNA processing protein 1 homolog B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 758 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP1BQ14684 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RRP1BQ14684 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RRP1BQ14684 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
RRP1BQ14684 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RRP1BQ14684 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RRP1BQ14684 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
RRP1BQ14684 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
RRP1BQ14684 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RRP1BQ14684 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RRP1BQ14684 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
RRP1BQ14684 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RRP1BQ14684 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
RRP1BQ14684 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RRP1BQ14684 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RRP1BQ14684 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
RRP1BQ14684 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RRP1BQ14684 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
RRP1BQ14684 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
RRP1BQ14684 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC20.81■□□□□ 0.92
RRP1BQ14684 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
RRP1BQ14684 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
RRP1BQ14684 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RRP1BQ14684 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RRP1BQ14684 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RRP1BQ14684 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
RRP1BQ14684 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
RRP1BQ14684 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
RRP1BQ14684 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RRP1BQ14684 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RRP1BQ14684 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RRP1BQ14684 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RRP1BQ14684 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RRP1BQ14684 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RRP1BQ14684 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RRP1BQ14684 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RRP1BQ14684 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RRP1BQ14684 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RRP1BQ14684 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RRP1BQ14684 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RRP1BQ14684 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RRP1BQ14684 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RRP1BQ14684 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RRP1BQ14684 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RRP1BQ14684 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RRP1BQ14684 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RRP1BQ14684 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RRP1BQ14684 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RRP1BQ14684 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RRP1BQ14684 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RRP1BQ14684 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RRP1BQ14684 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RRP1BQ14684 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RRP1BQ14684 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RRP1BQ14684 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RRP1BQ14684 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RRP1BQ14684 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RRP1BQ14684 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RRP1BQ14684 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RRP1BQ14684 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RRP1BQ14684 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RRP1BQ14684 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RRP1BQ14684 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RRP1BQ14684 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RRP1BQ14684 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
RRP1BQ14684 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RRP1BQ14684 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RRP1BQ14684 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RRP1BQ14684 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RRP1BQ14684 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RRP1BQ14684 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RRP1BQ14684 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
RRP1BQ14684 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RRP1BQ14684 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RRP1BQ14684 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RRP1BQ14684 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RRP1BQ14684 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RRP1BQ14684 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RRP1BQ14684 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RRP1BQ14684 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RRP1BQ14684 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RRP1BQ14684 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RRP1BQ14684 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RRP1BQ14684 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RRP1BQ14684 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RRP1BQ14684 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RRP1BQ14684 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
RRP1BQ14684 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
RRP1BQ14684 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
RRP1BQ14684 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RRP1BQ14684 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RRP1BQ14684 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RRP1BQ14684 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
RRP1BQ14684 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RRP1BQ14684 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
RRP1BQ14684 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RRP1BQ14684 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RRP1BQ14684 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RRP1BQ14684 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RRP1BQ14684 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RRP1BQ14684 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
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