Protein–RNA interactions for Protein: Q13950

RUNX2, Runt-related transcription factor 2, humanhuman

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Length 521 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX2Q13950 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RUNX2Q13950 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RUNX2Q13950 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RUNX2Q13950 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RUNX2Q13950 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RUNX2Q13950 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RUNX2Q13950 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RUNX2Q13950 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RUNX2Q13950 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RUNX2Q13950 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RUNX2Q13950 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RUNX2Q13950 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RUNX2Q13950 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RUNX2Q13950 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RUNX2Q13950 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RUNX2Q13950 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
RUNX2Q13950 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RUNX2Q13950 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RUNX2Q13950 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RUNX2Q13950 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
RUNX2Q13950 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
RUNX2Q13950 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RUNX2Q13950 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RUNX2Q13950 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RUNX2Q13950 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RUNX2Q13950 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RUNX2Q13950 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RUNX2Q13950 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RUNX2Q13950 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RUNX2Q13950 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RUNX2Q13950 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
RUNX2Q13950 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RUNX2Q13950 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RUNX2Q13950 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
RUNX2Q13950 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
RUNX2Q13950 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
RUNX2Q13950 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
RUNX2Q13950 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
RUNX2Q13950 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RUNX2Q13950 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RUNX2Q13950 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RUNX2Q13950 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RUNX2Q13950 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RUNX2Q13950 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RUNX2Q13950 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RUNX2Q13950 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RUNX2Q13950 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RUNX2Q13950 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RUNX2Q13950 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RUNX2Q13950 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RUNX2Q13950 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RUNX2Q13950 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RUNX2Q13950 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RUNX2Q13950 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RUNX2Q13950 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RUNX2Q13950 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RUNX2Q13950 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RUNX2Q13950 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RUNX2Q13950 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RUNX2Q13950 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RUNX2Q13950 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RUNX2Q13950 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RUNX2Q13950 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RUNX2Q13950 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RUNX2Q13950 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RUNX2Q13950 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RUNX2Q13950 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RUNX2Q13950 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RUNX2Q13950 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RUNX2Q13950 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RUNX2Q13950 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RUNX2Q13950 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RUNX2Q13950 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RUNX2Q13950 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RUNX2Q13950 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RUNX2Q13950 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RUNX2Q13950 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RUNX2Q13950 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RUNX2Q13950 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RUNX2Q13950 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RUNX2Q13950 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RUNX2Q13950 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RUNX2Q13950 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RUNX2Q13950 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
RUNX2Q13950 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RUNX2Q13950 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RUNX2Q13950 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RUNX2Q13950 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RUNX2Q13950 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RUNX2Q13950 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RUNX2Q13950 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RUNX2Q13950 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RUNX2Q13950 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
RUNX2Q13950 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RUNX2Q13950 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RUNX2Q13950 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RUNX2Q13950 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RUNX2Q13950 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RUNX2Q13950 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RUNX2Q13950 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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