Protein–RNA interactions for Protein: Q13425

SNTB2, Beta-2-syntrophin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 540 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNTB2Q13425 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNTB2Q13425 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNTB2Q13425 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNTB2Q13425 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SNTB2Q13425 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNTB2Q13425 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNTB2Q13425 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNTB2Q13425 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNTB2Q13425 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNTB2Q13425 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNTB2Q13425 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNTB2Q13425 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNTB2Q13425 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNTB2Q13425 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNTB2Q13425 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNTB2Q13425 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNTB2Q13425 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNTB2Q13425 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNTB2Q13425 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNTB2Q13425 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNTB2Q13425 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNTB2Q13425 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNTB2Q13425 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNTB2Q13425 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNTB2Q13425 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNTB2Q13425 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNTB2Q13425 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNTB2Q13425 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNTB2Q13425 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SNTB2Q13425 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNTB2Q13425 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNTB2Q13425 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNTB2Q13425 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNTB2Q13425 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNTB2Q13425 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNTB2Q13425 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNTB2Q13425 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNTB2Q13425 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNTB2Q13425 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNTB2Q13425 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNTB2Q13425 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNTB2Q13425 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNTB2Q13425 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNTB2Q13425 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SNTB2Q13425 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SNTB2Q13425 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SNTB2Q13425 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SNTB2Q13425 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
SNTB2Q13425 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SNTB2Q13425 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SNTB2Q13425 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SNTB2Q13425 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNTB2Q13425 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNTB2Q13425 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SNTB2Q13425 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNTB2Q13425 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNTB2Q13425 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNTB2Q13425 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNTB2Q13425 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNTB2Q13425 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNTB2Q13425 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNTB2Q13425 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNTB2Q13425 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNTB2Q13425 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SNTB2Q13425 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SNTB2Q13425 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SNTB2Q13425 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SNTB2Q13425 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNTB2Q13425 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNTB2Q13425 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SNTB2Q13425 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNTB2Q13425 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNTB2Q13425 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNTB2Q13425 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SNTB2Q13425 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SNTB2Q13425 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNTB2Q13425 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SNTB2Q13425 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SNTB2Q13425 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNTB2Q13425 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNTB2Q13425 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNTB2Q13425 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNTB2Q13425 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNTB2Q13425 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNTB2Q13425 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNTB2Q13425 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNTB2Q13425 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNTB2Q13425 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNTB2Q13425 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNTB2Q13425 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNTB2Q13425 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNTB2Q13425 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNTB2Q13425 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNTB2Q13425 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNTB2Q13425 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNTB2Q13425 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNTB2Q13425 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNTB2Q13425 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNTB2Q13425 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNTB2Q13425 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms