Protein–RNA interactions for Protein: Q12774

ARHGEF5, Rho guanine nucleotide exchange factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF5Q12774 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
ARHGEF5Q12774 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ARHGEF5Q12774 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ARHGEF5Q12774 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ARHGEF5Q12774 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ARHGEF5Q12774 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ARHGEF5Q12774 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ARHGEF5Q12774 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ARHGEF5Q12774 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ARHGEF5Q12774 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ARHGEF5Q12774 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ARHGEF5Q12774 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
ARHGEF5Q12774 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
ARHGEF5Q12774 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ARHGEF5Q12774 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ARHGEF5Q12774 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ARHGEF5Q12774 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ARHGEF5Q12774 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ARHGEF5Q12774 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ARHGEF5Q12774 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ARHGEF5Q12774 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ARHGEF5Q12774 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ARHGEF5Q12774 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ARHGEF5Q12774 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ARHGEF5Q12774 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ARHGEF5Q12774 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ARHGEF5Q12774 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ARHGEF5Q12774 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ARHGEF5Q12774 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ARHGEF5Q12774 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
ARHGEF5Q12774 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ARHGEF5Q12774 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
ARHGEF5Q12774 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ARHGEF5Q12774 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ARHGEF5Q12774 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
ARHGEF5Q12774 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ARHGEF5Q12774 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ARHGEF5Q12774 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ARHGEF5Q12774 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ARHGEF5Q12774 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ARHGEF5Q12774 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ARHGEF5Q12774 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ARHGEF5Q12774 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ARHGEF5Q12774 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ARHGEF5Q12774 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
ARHGEF5Q12774 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ARHGEF5Q12774 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ARHGEF5Q12774 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ARHGEF5Q12774 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ARHGEF5Q12774 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ARHGEF5Q12774 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ARHGEF5Q12774 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ARHGEF5Q12774 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ARHGEF5Q12774 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ARHGEF5Q12774 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ARHGEF5Q12774 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ARHGEF5Q12774 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ARHGEF5Q12774 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ARHGEF5Q12774 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
ARHGEF5Q12774 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ARHGEF5Q12774 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
ARHGEF5Q12774 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
ARHGEF5Q12774 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
ARHGEF5Q12774 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
ARHGEF5Q12774 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
ARHGEF5Q12774 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ARHGEF5Q12774 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
ARHGEF5Q12774 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ARHGEF5Q12774 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
ARHGEF5Q12774 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ARHGEF5Q12774 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
ARHGEF5Q12774 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
ARHGEF5Q12774 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
ARHGEF5Q12774 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ARHGEF5Q12774 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ARHGEF5Q12774 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ARHGEF5Q12774 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ARHGEF5Q12774 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ARHGEF5Q12774 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ARHGEF5Q12774 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ARHGEF5Q12774 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ARHGEF5Q12774 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ARHGEF5Q12774 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ARHGEF5Q12774 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ARHGEF5Q12774 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ARHGEF5Q12774 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ARHGEF5Q12774 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
ARHGEF5Q12774 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ARHGEF5Q12774 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ARHGEF5Q12774 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ARHGEF5Q12774 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
ARHGEF5Q12774 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ARHGEF5Q12774 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
ARHGEF5Q12774 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ARHGEF5Q12774 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ARHGEF5Q12774 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ARHGEF5Q12774 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ARHGEF5Q12774 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
ARHGEF5Q12774 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ARHGEF5Q12774 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.1 ms