Protein–RNA interactions for Protein: Q12770

SCAP, Sterol regulatory element-binding protein cleavage-activating protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,279 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPQ12770 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SCAPQ12770 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SCAPQ12770 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SCAPQ12770 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SCAPQ12770 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SCAPQ12770 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SCAPQ12770 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SCAPQ12770 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SCAPQ12770 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SCAPQ12770 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SCAPQ12770 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SCAPQ12770 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SCAPQ12770 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SCAPQ12770 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCAPQ12770 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCAPQ12770 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCAPQ12770 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCAPQ12770 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCAPQ12770 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCAPQ12770 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCAPQ12770 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCAPQ12770 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCAPQ12770 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCAPQ12770 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCAPQ12770 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCAPQ12770 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCAPQ12770 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SCAPQ12770 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCAPQ12770 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCAPQ12770 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCAPQ12770 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCAPQ12770 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCAPQ12770 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SCAPQ12770 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCAPQ12770 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCAPQ12770 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCAPQ12770 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SCAPQ12770 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCAPQ12770 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SCAPQ12770 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SCAPQ12770 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SCAPQ12770 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SCAPQ12770 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SCAPQ12770 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCAPQ12770 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCAPQ12770 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCAPQ12770 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCAPQ12770 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCAPQ12770 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCAPQ12770 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCAPQ12770 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SCAPQ12770 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCAPQ12770 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SCAPQ12770 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCAPQ12770 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SCAPQ12770 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SCAPQ12770 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SCAPQ12770 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SCAPQ12770 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SCAPQ12770 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SCAPQ12770 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SCAPQ12770 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SCAPQ12770 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SCAPQ12770 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SCAPQ12770 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SCAPQ12770 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SCAPQ12770 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SCAPQ12770 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SCAPQ12770 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SCAPQ12770 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SCAPQ12770 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SCAPQ12770 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SCAPQ12770 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SCAPQ12770 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SCAPQ12770 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SCAPQ12770 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCAPQ12770 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCAPQ12770 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCAPQ12770 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCAPQ12770 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCAPQ12770 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCAPQ12770 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCAPQ12770 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCAPQ12770 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCAPQ12770 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCAPQ12770 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCAPQ12770 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCAPQ12770 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SCAPQ12770 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCAPQ12770 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCAPQ12770 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCAPQ12770 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCAPQ12770 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCAPQ12770 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SCAPQ12770 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCAPQ12770 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCAPQ12770 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCAPQ12770 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SCAPQ12770 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCAPQ12770 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
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