Protein–RNA interactions for Protein: Q05D60

DEUP1, Deuterosome assembly protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEUP1Q05D60 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
DEUP1Q05D60 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
DEUP1Q05D60 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
DEUP1Q05D60 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
DEUP1Q05D60 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
DEUP1Q05D60 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
DEUP1Q05D60 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
DEUP1Q05D60 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
DEUP1Q05D60 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
DEUP1Q05D60 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
DEUP1Q05D60 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
DEUP1Q05D60 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
DEUP1Q05D60 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
DEUP1Q05D60 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
DEUP1Q05D60 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
DEUP1Q05D60 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
DEUP1Q05D60 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
DEUP1Q05D60 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
DEUP1Q05D60 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
DEUP1Q05D60 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
DEUP1Q05D60 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
DEUP1Q05D60 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
DEUP1Q05D60 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
DEUP1Q05D60 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
DEUP1Q05D60 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
DEUP1Q05D60 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
DEUP1Q05D60 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
DEUP1Q05D60 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
DEUP1Q05D60 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
DEUP1Q05D60 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
DEUP1Q05D60 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
DEUP1Q05D60 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
DEUP1Q05D60 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
DEUP1Q05D60 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
DEUP1Q05D60 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
DEUP1Q05D60 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
DEUP1Q05D60 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
DEUP1Q05D60 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
DEUP1Q05D60 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
DEUP1Q05D60 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
DEUP1Q05D60 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
DEUP1Q05D60 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
DEUP1Q05D60 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
DEUP1Q05D60 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
DEUP1Q05D60 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
DEUP1Q05D60 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
DEUP1Q05D60 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
DEUP1Q05D60 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
DEUP1Q05D60 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
DEUP1Q05D60 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
DEUP1Q05D60 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
DEUP1Q05D60 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
DEUP1Q05D60 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
DEUP1Q05D60 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
DEUP1Q05D60 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
DEUP1Q05D60 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
DEUP1Q05D60 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
DEUP1Q05D60 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
DEUP1Q05D60 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
DEUP1Q05D60 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
DEUP1Q05D60 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
DEUP1Q05D60 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
DEUP1Q05D60 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
DEUP1Q05D60 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
DEUP1Q05D60 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
DEUP1Q05D60 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
DEUP1Q05D60 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
DEUP1Q05D60 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
DEUP1Q05D60 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
DEUP1Q05D60 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
DEUP1Q05D60 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
DEUP1Q05D60 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
DEUP1Q05D60 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
DEUP1Q05D60 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
DEUP1Q05D60 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
DEUP1Q05D60 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DEUP1Q05D60 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DEUP1Q05D60 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DEUP1Q05D60 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DEUP1Q05D60 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DEUP1Q05D60 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DEUP1Q05D60 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
DEUP1Q05D60 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DEUP1Q05D60 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DEUP1Q05D60 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DEUP1Q05D60 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DEUP1Q05D60 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DEUP1Q05D60 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DEUP1Q05D60 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
DEUP1Q05D60 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
DEUP1Q05D60 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
DEUP1Q05D60 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
DEUP1Q05D60 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DEUP1Q05D60 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
DEUP1Q05D60 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DEUP1Q05D60 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DEUP1Q05D60 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
DEUP1Q05D60 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DEUP1Q05D60 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
DEUP1Q05D60 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.6 ms