Protein–RNA interactions for Protein: Q05519

SRSF11, Serine/arginine-rich splicing factor 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF11Q05519 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SRSF11Q05519 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SRSF11Q05519 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SRSF11Q05519 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SRSF11Q05519 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SRSF11Q05519 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SRSF11Q05519 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SRSF11Q05519 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SRSF11Q05519 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SRSF11Q05519 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SRSF11Q05519 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SRSF11Q05519 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SRSF11Q05519 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SRSF11Q05519 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SRSF11Q05519 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SRSF11Q05519 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
SRSF11Q05519 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SRSF11Q05519 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SRSF11Q05519 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SRSF11Q05519 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SRSF11Q05519 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SRSF11Q05519 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
SRSF11Q05519 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SRSF11Q05519 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SRSF11Q05519 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SRSF11Q05519 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SRSF11Q05519 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
SRSF11Q05519 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SRSF11Q05519 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SRSF11Q05519 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SRSF11Q05519 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SRSF11Q05519 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SRSF11Q05519 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SRSF11Q05519 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SRSF11Q05519 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SRSF11Q05519 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SRSF11Q05519 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SRSF11Q05519 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SRSF11Q05519 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SRSF11Q05519 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SRSF11Q05519 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SRSF11Q05519 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SRSF11Q05519 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SRSF11Q05519 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SRSF11Q05519 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SRSF11Q05519 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SRSF11Q05519 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SRSF11Q05519 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SRSF11Q05519 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SRSF11Q05519 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SRSF11Q05519 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SRSF11Q05519 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SRSF11Q05519 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SRSF11Q05519 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SRSF11Q05519 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SRSF11Q05519 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SRSF11Q05519 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SRSF11Q05519 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SRSF11Q05519 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
SRSF11Q05519 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
SRSF11Q05519 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
SRSF11Q05519 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SRSF11Q05519 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SRSF11Q05519 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
SRSF11Q05519 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SRSF11Q05519 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SRSF11Q05519 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SRSF11Q05519 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SRSF11Q05519 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SRSF11Q05519 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SRSF11Q05519 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SRSF11Q05519 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SRSF11Q05519 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SRSF11Q05519 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SRSF11Q05519 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SRSF11Q05519 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SRSF11Q05519 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SRSF11Q05519 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SRSF11Q05519 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SRSF11Q05519 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SRSF11Q05519 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SRSF11Q05519 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SRSF11Q05519 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SRSF11Q05519 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SRSF11Q05519 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SRSF11Q05519 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
SRSF11Q05519 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SRSF11Q05519 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
SRSF11Q05519 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SRSF11Q05519 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SRSF11Q05519 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SRSF11Q05519 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SRSF11Q05519 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SRSF11Q05519 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SRSF11Q05519 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SRSF11Q05519 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SRSF11Q05519 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SRSF11Q05519 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SRSF11Q05519 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SRSF11Q05519 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms