Protein–RNA interactions for Protein: Q05209

PTPN12, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN12Q05209 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTPN12Q05209 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTPN12Q05209 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTPN12Q05209 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTPN12Q05209 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTPN12Q05209 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTPN12Q05209 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTPN12Q05209 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTPN12Q05209 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PTPN12Q05209 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PTPN12Q05209 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPN12Q05209 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPN12Q05209 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPN12Q05209 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPN12Q05209 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPN12Q05209 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPN12Q05209 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPN12Q05209 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPN12Q05209 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPN12Q05209 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPN12Q05209 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPN12Q05209 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPN12Q05209 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPN12Q05209 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPN12Q05209 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPN12Q05209 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPN12Q05209 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPN12Q05209 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPN12Q05209 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPN12Q05209 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPN12Q05209 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPN12Q05209 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPN12Q05209 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPN12Q05209 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPN12Q05209 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPN12Q05209 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPN12Q05209 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPN12Q05209 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PTPN12Q05209 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PTPN12Q05209 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PTPN12Q05209 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PTPN12Q05209 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PTPN12Q05209 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PTPN12Q05209 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PTPN12Q05209 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PTPN12Q05209 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PTPN12Q05209 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PTPN12Q05209 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PTPN12Q05209 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
PTPN12Q05209 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PTPN12Q05209 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PTPN12Q05209 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PTPN12Q05209 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PTPN12Q05209 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PTPN12Q05209 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
PTPN12Q05209 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PTPN12Q05209 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PTPN12Q05209 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
PTPN12Q05209 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PTPN12Q05209 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PTPN12Q05209 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PTPN12Q05209 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
PTPN12Q05209 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PTPN12Q05209 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PTPN12Q05209 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PTPN12Q05209 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PTPN12Q05209 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PTPN12Q05209 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PTPN12Q05209 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PTPN12Q05209 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PTPN12Q05209 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPN12Q05209 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPN12Q05209 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPN12Q05209 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPN12Q05209 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPN12Q05209 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPN12Q05209 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPN12Q05209 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPN12Q05209 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPN12Q05209 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPN12Q05209 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPN12Q05209 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPN12Q05209 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPN12Q05209 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPN12Q05209 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPN12Q05209 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPN12Q05209 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPN12Q05209 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPN12Q05209 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPN12Q05209 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPN12Q05209 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPN12Q05209 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPN12Q05209 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPN12Q05209 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPN12Q05209 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPN12Q05209 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPN12Q05209 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPN12Q05209 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPN12Q05209 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPN12Q05209 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms