Protein–RNA interactions for Protein: Q04837

SSBP1, Single-stranded DNA-binding protein, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP1Q04837 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSBP1Q04837 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSBP1Q04837 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSBP1Q04837 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSBP1Q04837 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSBP1Q04837 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SSBP1Q04837 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SSBP1Q04837 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSBP1Q04837 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSBP1Q04837 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSBP1Q04837 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSBP1Q04837 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSBP1Q04837 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSBP1Q04837 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSBP1Q04837 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSBP1Q04837 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSBP1Q04837 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSBP1Q04837 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SSBP1Q04837 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSBP1Q04837 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SSBP1Q04837 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SSBP1Q04837 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SSBP1Q04837 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SSBP1Q04837 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SSBP1Q04837 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SSBP1Q04837 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SSBP1Q04837 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SSBP1Q04837 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SSBP1Q04837 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SSBP1Q04837 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SSBP1Q04837 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SSBP1Q04837 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SSBP1Q04837 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SSBP1Q04837 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SSBP1Q04837 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SSBP1Q04837 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SSBP1Q04837 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SSBP1Q04837 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SSBP1Q04837 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SSBP1Q04837 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SSBP1Q04837 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SSBP1Q04837 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SSBP1Q04837 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SSBP1Q04837 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SSBP1Q04837 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SSBP1Q04837 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SSBP1Q04837 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SSBP1Q04837 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SSBP1Q04837 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SSBP1Q04837 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SSBP1Q04837 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SSBP1Q04837 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SSBP1Q04837 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SSBP1Q04837 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SSBP1Q04837 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SSBP1Q04837 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SSBP1Q04837 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SSBP1Q04837 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SSBP1Q04837 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SSBP1Q04837 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SSBP1Q04837 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SSBP1Q04837 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SSBP1Q04837 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SSBP1Q04837 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SSBP1Q04837 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SSBP1Q04837 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SSBP1Q04837 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SSBP1Q04837 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SSBP1Q04837 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SSBP1Q04837 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SSBP1Q04837 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SSBP1Q04837 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SSBP1Q04837 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SSBP1Q04837 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SSBP1Q04837 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SSBP1Q04837 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SSBP1Q04837 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SSBP1Q04837 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SSBP1Q04837 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SSBP1Q04837 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SSBP1Q04837 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SSBP1Q04837 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SSBP1Q04837 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SSBP1Q04837 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SSBP1Q04837 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SSBP1Q04837 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SSBP1Q04837 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SSBP1Q04837 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SSBP1Q04837 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SSBP1Q04837 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SSBP1Q04837 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SSBP1Q04837 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SSBP1Q04837 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SSBP1Q04837 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SSBP1Q04837 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SSBP1Q04837 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SSBP1Q04837 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SSBP1Q04837 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SSBP1Q04837 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SSBP1Q04837 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms