Protein–RNA interactions for Protein: Q03060

CREM, cAMP-responsive element modulator, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREMQ03060 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CREMQ03060 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CREMQ03060 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CREMQ03060 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CREMQ03060 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CREMQ03060 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CREMQ03060 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
CREMQ03060 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CREMQ03060 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
CREMQ03060 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
CREMQ03060 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CREMQ03060 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CREMQ03060 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CREMQ03060 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CREMQ03060 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CREMQ03060 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
CREMQ03060 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CREMQ03060 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
CREMQ03060 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CREMQ03060 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CREMQ03060 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CREMQ03060 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CREMQ03060 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CREMQ03060 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CREMQ03060 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CREMQ03060 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CREMQ03060 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CREMQ03060 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CREMQ03060 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CREMQ03060 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CREMQ03060 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CREMQ03060 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CREMQ03060 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CREMQ03060 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CREMQ03060 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
CREMQ03060 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CREMQ03060 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CREMQ03060 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
CREMQ03060 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CREMQ03060 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CREMQ03060 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CREMQ03060 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CREMQ03060 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CREMQ03060 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CREMQ03060 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
CREMQ03060 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CREMQ03060 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CREMQ03060 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CREMQ03060 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
CREMQ03060 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CREMQ03060 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CREMQ03060 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
CREMQ03060 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CREMQ03060 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CREMQ03060 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CREMQ03060 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CREMQ03060 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CREMQ03060 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CREMQ03060 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
CREMQ03060 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CREMQ03060 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CREMQ03060 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CREMQ03060 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CREMQ03060 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CREMQ03060 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CREMQ03060 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CREMQ03060 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CREMQ03060 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CREMQ03060 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CREMQ03060 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CREMQ03060 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CREMQ03060 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CREMQ03060 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CREMQ03060 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CREMQ03060 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CREMQ03060 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
CREMQ03060 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
CREMQ03060 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CREMQ03060 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CREMQ03060 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CREMQ03060 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CREMQ03060 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
CREMQ03060 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CREMQ03060 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CREMQ03060 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
CREMQ03060 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CREMQ03060 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CREMQ03060 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CREMQ03060 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CREMQ03060 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CREMQ03060 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CREMQ03060 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CREMQ03060 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CREMQ03060 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CREMQ03060 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CREMQ03060 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CREMQ03060 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CREMQ03060 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CREMQ03060 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CREMQ03060 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms