Protein–RNA interactions for Protein: Q02297

NRG1, Pro-neuregulin-1, membrane-bound isoform, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 640 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRG1Q02297 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NRG1Q02297 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NRG1Q02297 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NRG1Q02297 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NRG1Q02297 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NRG1Q02297 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NRG1Q02297 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NRG1Q02297 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NRG1Q02297 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NRG1Q02297 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NRG1Q02297 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NRG1Q02297 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NRG1Q02297 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NRG1Q02297 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NRG1Q02297 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NRG1Q02297 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NRG1Q02297 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NRG1Q02297 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NRG1Q02297 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
NRG1Q02297 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NRG1Q02297 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NRG1Q02297 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NRG1Q02297 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NRG1Q02297 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NRG1Q02297 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
NRG1Q02297 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NRG1Q02297 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NRG1Q02297 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NRG1Q02297 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NRG1Q02297 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NRG1Q02297 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
NRG1Q02297 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NRG1Q02297 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NRG1Q02297 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NRG1Q02297 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NRG1Q02297 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NRG1Q02297 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NRG1Q02297 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NRG1Q02297 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NRG1Q02297 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NRG1Q02297 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NRG1Q02297 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NRG1Q02297 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NRG1Q02297 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NRG1Q02297 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
NRG1Q02297 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NRG1Q02297 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NRG1Q02297 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NRG1Q02297 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NRG1Q02297 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
NRG1Q02297 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
NRG1Q02297 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NRG1Q02297 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NRG1Q02297 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NRG1Q02297 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NRG1Q02297 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NRG1Q02297 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NRG1Q02297 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NRG1Q02297 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NRG1Q02297 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NRG1Q02297 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NRG1Q02297 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NRG1Q02297 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NRG1Q02297 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NRG1Q02297 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NRG1Q02297 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NRG1Q02297 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NRG1Q02297 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NRG1Q02297 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NRG1Q02297 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NRG1Q02297 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NRG1Q02297 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NRG1Q02297 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NRG1Q02297 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NRG1Q02297 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NRG1Q02297 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NRG1Q02297 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NRG1Q02297 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NRG1Q02297 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NRG1Q02297 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NRG1Q02297 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NRG1Q02297 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NRG1Q02297 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NRG1Q02297 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NRG1Q02297 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NRG1Q02297 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NRG1Q02297 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NRG1Q02297 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
NRG1Q02297 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NRG1Q02297 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
NRG1Q02297 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NRG1Q02297 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
NRG1Q02297 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NRG1Q02297 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NRG1Q02297 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NRG1Q02297 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NRG1Q02297 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NRG1Q02297 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
NRG1Q02297 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NRG1Q02297 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.1 ms