Protein–RNA interactions for Protein: Q01780

EXOSC10, Exosome component 10, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 885 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC10Q01780 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
EXOSC10Q01780 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
EXOSC10Q01780 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
EXOSC10Q01780 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
EXOSC10Q01780 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
EXOSC10Q01780 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
EXOSC10Q01780 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
EXOSC10Q01780 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
EXOSC10Q01780 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
EXOSC10Q01780 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
EXOSC10Q01780 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
EXOSC10Q01780 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
EXOSC10Q01780 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
EXOSC10Q01780 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
EXOSC10Q01780 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
EXOSC10Q01780 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
EXOSC10Q01780 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
EXOSC10Q01780 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
EXOSC10Q01780 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
EXOSC10Q01780 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
EXOSC10Q01780 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
EXOSC10Q01780 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
EXOSC10Q01780 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
EXOSC10Q01780 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
EXOSC10Q01780 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
EXOSC10Q01780 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
EXOSC10Q01780 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
EXOSC10Q01780 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
EXOSC10Q01780 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
EXOSC10Q01780 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
EXOSC10Q01780 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
EXOSC10Q01780 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
EXOSC10Q01780 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
EXOSC10Q01780 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
EXOSC10Q01780 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
EXOSC10Q01780 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
EXOSC10Q01780 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
EXOSC10Q01780 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
EXOSC10Q01780 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
EXOSC10Q01780 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
EXOSC10Q01780 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
EXOSC10Q01780 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
EXOSC10Q01780 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
EXOSC10Q01780 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
EXOSC10Q01780 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
EXOSC10Q01780 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
EXOSC10Q01780 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
EXOSC10Q01780 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
EXOSC10Q01780 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
EXOSC10Q01780 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
EXOSC10Q01780 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
EXOSC10Q01780 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
EXOSC10Q01780 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
EXOSC10Q01780 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
EXOSC10Q01780 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
EXOSC10Q01780 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
EXOSC10Q01780 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
EXOSC10Q01780 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
EXOSC10Q01780 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
EXOSC10Q01780 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
EXOSC10Q01780 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
EXOSC10Q01780 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
EXOSC10Q01780 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
EXOSC10Q01780 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
EXOSC10Q01780 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
EXOSC10Q01780 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
EXOSC10Q01780 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
EXOSC10Q01780 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
EXOSC10Q01780 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
EXOSC10Q01780 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
EXOSC10Q01780 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
EXOSC10Q01780 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
EXOSC10Q01780 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
EXOSC10Q01780 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC20.93■□□□□ 0.94
EXOSC10Q01780 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
EXOSC10Q01780 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
EXOSC10Q01780 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
EXOSC10Q01780 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
EXOSC10Q01780 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
EXOSC10Q01780 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
EXOSC10Q01780 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
EXOSC10Q01780 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
EXOSC10Q01780 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
EXOSC10Q01780 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
EXOSC10Q01780 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
EXOSC10Q01780 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
EXOSC10Q01780 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
EXOSC10Q01780 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC20.92■□□□□ 0.94
EXOSC10Q01780 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
EXOSC10Q01780 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
EXOSC10Q01780 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
EXOSC10Q01780 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
EXOSC10Q01780 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
EXOSC10Q01780 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
EXOSC10Q01780 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
EXOSC10Q01780 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
EXOSC10Q01780 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
EXOSC10Q01780 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
EXOSC10Q01780 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
EXOSC10Q01780 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms