Protein–RNA interactions for Protein: Q01726

MC1R, Melanocyte-stimulating hormone receptor, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MC1RQ01726 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
MC1RQ01726 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
MC1RQ01726 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MC1RQ01726 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MC1RQ01726 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
MC1RQ01726 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
MC1RQ01726 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MC1RQ01726 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MC1RQ01726 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
MC1RQ01726 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
MC1RQ01726 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
MC1RQ01726 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
MC1RQ01726 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
MC1RQ01726 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
MC1RQ01726 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
MC1RQ01726 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
MC1RQ01726 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MC1RQ01726 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MC1RQ01726 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MC1RQ01726 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MC1RQ01726 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
MC1RQ01726 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MC1RQ01726 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MC1RQ01726 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MC1RQ01726 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
MC1RQ01726 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MC1RQ01726 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MC1RQ01726 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MC1RQ01726 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MC1RQ01726 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MC1RQ01726 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MC1RQ01726 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MC1RQ01726 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MC1RQ01726 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MC1RQ01726 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MC1RQ01726 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MC1RQ01726 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MC1RQ01726 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MC1RQ01726 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MC1RQ01726 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
MC1RQ01726 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MC1RQ01726 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MC1RQ01726 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MC1RQ01726 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MC1RQ01726 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MC1RQ01726 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MC1RQ01726 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MC1RQ01726 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MC1RQ01726 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MC1RQ01726 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MC1RQ01726 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MC1RQ01726 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MC1RQ01726 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MC1RQ01726 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MC1RQ01726 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MC1RQ01726 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MC1RQ01726 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MC1RQ01726 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MC1RQ01726 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MC1RQ01726 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MC1RQ01726 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MC1RQ01726 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MC1RQ01726 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MC1RQ01726 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MC1RQ01726 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MC1RQ01726 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MC1RQ01726 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
MC1RQ01726 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
MC1RQ01726 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MC1RQ01726 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MC1RQ01726 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MC1RQ01726 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MC1RQ01726 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
MC1RQ01726 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MC1RQ01726 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
MC1RQ01726 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MC1RQ01726 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MC1RQ01726 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
MC1RQ01726 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MC1RQ01726 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
MC1RQ01726 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MC1RQ01726 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
MC1RQ01726 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MC1RQ01726 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MC1RQ01726 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MC1RQ01726 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
MC1RQ01726 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MC1RQ01726 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MC1RQ01726 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MC1RQ01726 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MC1RQ01726 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MC1RQ01726 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MC1RQ01726 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MC1RQ01726 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
MC1RQ01726 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MC1RQ01726 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MC1RQ01726 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MC1RQ01726 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MC1RQ01726 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MC1RQ01726 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms