Protein–RNA interactions for Protein: Q01518

CAP1, Adenylyl cyclase-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAP1Q01518 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CAP1Q01518 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CAP1Q01518 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CAP1Q01518 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CAP1Q01518 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CAP1Q01518 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CAP1Q01518 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CAP1Q01518 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CAP1Q01518 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CAP1Q01518 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CAP1Q01518 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CAP1Q01518 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CAP1Q01518 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CAP1Q01518 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CAP1Q01518 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CAP1Q01518 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CAP1Q01518 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CAP1Q01518 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CAP1Q01518 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CAP1Q01518 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CAP1Q01518 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CAP1Q01518 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CAP1Q01518 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CAP1Q01518 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CAP1Q01518 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CAP1Q01518 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CAP1Q01518 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CAP1Q01518 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CAP1Q01518 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CAP1Q01518 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CAP1Q01518 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CAP1Q01518 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CAP1Q01518 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CAP1Q01518 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CAP1Q01518 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CAP1Q01518 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CAP1Q01518 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CAP1Q01518 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CAP1Q01518 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CAP1Q01518 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CAP1Q01518 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CAP1Q01518 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CAP1Q01518 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CAP1Q01518 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CAP1Q01518 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CAP1Q01518 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CAP1Q01518 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CAP1Q01518 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CAP1Q01518 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CAP1Q01518 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CAP1Q01518 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CAP1Q01518 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CAP1Q01518 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CAP1Q01518 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CAP1Q01518 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CAP1Q01518 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CAP1Q01518 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CAP1Q01518 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CAP1Q01518 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CAP1Q01518 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CAP1Q01518 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CAP1Q01518 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CAP1Q01518 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CAP1Q01518 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CAP1Q01518 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CAP1Q01518 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CAP1Q01518 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CAP1Q01518 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CAP1Q01518 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CAP1Q01518 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CAP1Q01518 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CAP1Q01518 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CAP1Q01518 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CAP1Q01518 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CAP1Q01518 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CAP1Q01518 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CAP1Q01518 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CAP1Q01518 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CAP1Q01518 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CAP1Q01518 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CAP1Q01518 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CAP1Q01518 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CAP1Q01518 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CAP1Q01518 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CAP1Q01518 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CAP1Q01518 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CAP1Q01518 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CAP1Q01518 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CAP1Q01518 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CAP1Q01518 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CAP1Q01518 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CAP1Q01518 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CAP1Q01518 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CAP1Q01518 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CAP1Q01518 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CAP1Q01518 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CAP1Q01518 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CAP1Q01518 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CAP1Q01518 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CAP1Q01518 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms