Protein–RNA interactions for Protein: P82279

CRB1, Protein crumbs homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRB1P82279 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CRB1P82279 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CRB1P82279 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CRB1P82279 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CRB1P82279 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CRB1P82279 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CRB1P82279 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CRB1P82279 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CRB1P82279 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CRB1P82279 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CRB1P82279 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CRB1P82279 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
CRB1P82279 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CRB1P82279 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CRB1P82279 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CRB1P82279 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CRB1P82279 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CRB1P82279 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CRB1P82279 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CRB1P82279 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CRB1P82279 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CRB1P82279 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CRB1P82279 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CRB1P82279 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CRB1P82279 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CRB1P82279 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CRB1P82279 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CRB1P82279 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CRB1P82279 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CRB1P82279 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CRB1P82279 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CRB1P82279 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CRB1P82279 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CRB1P82279 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CRB1P82279 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CRB1P82279 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CRB1P82279 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CRB1P82279 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CRB1P82279 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CRB1P82279 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CRB1P82279 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CRB1P82279 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CRB1P82279 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CRB1P82279 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CRB1P82279 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CRB1P82279 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CRB1P82279 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CRB1P82279 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CRB1P82279 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CRB1P82279 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CRB1P82279 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CRB1P82279 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CRB1P82279 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CRB1P82279 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CRB1P82279 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CRB1P82279 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CRB1P82279 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CRB1P82279 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CRB1P82279 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CRB1P82279 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CRB1P82279 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CRB1P82279 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CRB1P82279 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CRB1P82279 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CRB1P82279 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CRB1P82279 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CRB1P82279 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CRB1P82279 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CRB1P82279 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CRB1P82279 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CRB1P82279 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CRB1P82279 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CRB1P82279 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CRB1P82279 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CRB1P82279 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CRB1P82279 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CRB1P82279 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CRB1P82279 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CRB1P82279 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CRB1P82279 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CRB1P82279 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CRB1P82279 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CRB1P82279 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CRB1P82279 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CRB1P82279 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CRB1P82279 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CRB1P82279 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CRB1P82279 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CRB1P82279 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CRB1P82279 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CRB1P82279 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CRB1P82279 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CRB1P82279 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CRB1P82279 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CRB1P82279 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CRB1P82279 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CRB1P82279 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CRB1P82279 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CRB1P82279 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CRB1P82279 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms