Protein–RNA interactions for Protein: P82094

TMF1, TATA element modulatory factor, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMF1P82094 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TMF1P82094 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
TMF1P82094 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
TMF1P82094 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TMF1P82094 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TMF1P82094 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TMF1P82094 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TMF1P82094 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TMF1P82094 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
TMF1P82094 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TMF1P82094 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TMF1P82094 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TMF1P82094 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TMF1P82094 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TMF1P82094 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TMF1P82094 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TMF1P82094 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TMF1P82094 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
TMF1P82094 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TMF1P82094 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TMF1P82094 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TMF1P82094 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TMF1P82094 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TMF1P82094 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TMF1P82094 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TMF1P82094 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TMF1P82094 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TMF1P82094 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TMF1P82094 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TMF1P82094 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TMF1P82094 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TMF1P82094 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TMF1P82094 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TMF1P82094 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TMF1P82094 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
TMF1P82094 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
TMF1P82094 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TMF1P82094 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TMF1P82094 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TMF1P82094 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TMF1P82094 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TMF1P82094 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TMF1P82094 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TMF1P82094 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TMF1P82094 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TMF1P82094 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TMF1P82094 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TMF1P82094 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TMF1P82094 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TMF1P82094 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TMF1P82094 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMF1P82094 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMF1P82094 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMF1P82094 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMF1P82094 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMF1P82094 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMF1P82094 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMF1P82094 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMF1P82094 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMF1P82094 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMF1P82094 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMF1P82094 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMF1P82094 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
TMF1P82094 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMF1P82094 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMF1P82094 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMF1P82094 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMF1P82094 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMF1P82094 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMF1P82094 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMF1P82094 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMF1P82094 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMF1P82094 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMF1P82094 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMF1P82094 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMF1P82094 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMF1P82094 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMF1P82094 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMF1P82094 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMF1P82094 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMF1P82094 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMF1P82094 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
TMF1P82094 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMF1P82094 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMF1P82094 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMF1P82094 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMF1P82094 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMF1P82094 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMF1P82094 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
TMF1P82094 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMF1P82094 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMF1P82094 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMF1P82094 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMF1P82094 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMF1P82094 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TMF1P82094 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TMF1P82094 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TMF1P82094 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TMF1P82094 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TMF1P82094 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms