Protein–RNA interactions for Protein: P78395

PRAME, Melanoma antigen preferentially expressed in tumors, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEP78395 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PRAMEP78395 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PRAMEP78395 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PRAMEP78395 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PRAMEP78395 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PRAMEP78395 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
PRAMEP78395 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PRAMEP78395 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PRAMEP78395 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PRAMEP78395 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PRAMEP78395 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PRAMEP78395 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PRAMEP78395 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PRAMEP78395 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PRAMEP78395 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PRAMEP78395 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PRAMEP78395 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PRAMEP78395 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PRAMEP78395 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PRAMEP78395 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PRAMEP78395 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PRAMEP78395 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PRAMEP78395 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PRAMEP78395 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
PRAMEP78395 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PRAMEP78395 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
PRAMEP78395 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PRAMEP78395 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PRAMEP78395 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PRAMEP78395 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
PRAMEP78395 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PRAMEP78395 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PRAMEP78395 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PRAMEP78395 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PRAMEP78395 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PRAMEP78395 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PRAMEP78395 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PRAMEP78395 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PRAMEP78395 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PRAMEP78395 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PRAMEP78395 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PRAMEP78395 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PRAMEP78395 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRAMEP78395 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRAMEP78395 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRAMEP78395 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRAMEP78395 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRAMEP78395 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRAMEP78395 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRAMEP78395 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRAMEP78395 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRAMEP78395 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRAMEP78395 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRAMEP78395 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRAMEP78395 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PRAMEP78395 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRAMEP78395 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRAMEP78395 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRAMEP78395 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRAMEP78395 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRAMEP78395 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PRAMEP78395 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRAMEP78395 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRAMEP78395 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PRAMEP78395 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRAMEP78395 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRAMEP78395 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRAMEP78395 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRAMEP78395 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRAMEP78395 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRAMEP78395 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PRAMEP78395 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRAMEP78395 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRAMEP78395 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRAMEP78395 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRAMEP78395 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRAMEP78395 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRAMEP78395 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRAMEP78395 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRAMEP78395 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRAMEP78395 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRAMEP78395 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRAMEP78395 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRAMEP78395 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRAMEP78395 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRAMEP78395 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRAMEP78395 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRAMEP78395 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRAMEP78395 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRAMEP78395 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PRAMEP78395 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRAMEP78395 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRAMEP78395 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRAMEP78395 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRAMEP78395 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRAMEP78395 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRAMEP78395 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRAMEP78395 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRAMEP78395 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRAMEP78395 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms