Protein–RNA interactions for Protein: P78364

PHC1, Polyhomeotic-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHC1P78364 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PHC1P78364 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PHC1P78364 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PHC1P78364 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
PHC1P78364 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
PHC1P78364 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PHC1P78364 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
PHC1P78364 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PHC1P78364 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PHC1P78364 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.33
PHC1P78364 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PHC1P78364 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PHC1P78364 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
PHC1P78364 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PHC1P78364 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PHC1P78364 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PHC1P78364 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PHC1P78364 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PHC1P78364 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PHC1P78364 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PHC1P78364 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
PHC1P78364 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PHC1P78364 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PHC1P78364 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PHC1P78364 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PHC1P78364 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PHC1P78364 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PHC1P78364 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PHC1P78364 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PHC1P78364 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PHC1P78364 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PHC1P78364 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PHC1P78364 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PHC1P78364 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PHC1P78364 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PHC1P78364 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PHC1P78364 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PHC1P78364 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PHC1P78364 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PHC1P78364 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PHC1P78364 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PHC1P78364 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PHC1P78364 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PHC1P78364 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PHC1P78364 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PHC1P78364 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PHC1P78364 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PHC1P78364 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PHC1P78364 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PHC1P78364 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
PHC1P78364 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PHC1P78364 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PHC1P78364 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PHC1P78364 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PHC1P78364 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PHC1P78364 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PHC1P78364 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PHC1P78364 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PHC1P78364 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PHC1P78364 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PHC1P78364 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PHC1P78364 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PHC1P78364 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PHC1P78364 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PHC1P78364 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PHC1P78364 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PHC1P78364 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PHC1P78364 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PHC1P78364 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PHC1P78364 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PHC1P78364 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PHC1P78364 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PHC1P78364 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PHC1P78364 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PHC1P78364 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PHC1P78364 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PHC1P78364 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
PHC1P78364 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PHC1P78364 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PHC1P78364 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PHC1P78364 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PHC1P78364 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PHC1P78364 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PHC1P78364 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PHC1P78364 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
PHC1P78364 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PHC1P78364 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PHC1P78364 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PHC1P78364 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PHC1P78364 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PHC1P78364 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PHC1P78364 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PHC1P78364 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PHC1P78364 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PHC1P78364 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PHC1P78364 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PHC1P78364 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PHC1P78364 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PHC1P78364 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PHC1P78364 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms