Protein–RNA interactions for Protein: P61165

TMEM258, Transmembrane protein 258, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM258P61165 WIZ-203ENST00000545156 4466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TMEM258P61165 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TMEM258P61165 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TMEM258P61165 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TMEM258P61165 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
TMEM258P61165 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TMEM258P61165 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TMEM258P61165 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
TMEM258P61165 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TMEM258P61165 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
TMEM258P61165 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TMEM258P61165 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TMEM258P61165 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
TMEM258P61165 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
TMEM258P61165 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TMEM258P61165 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TMEM258P61165 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TMEM258P61165 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC10.63□□□□□ -0.71
TMEM258P61165 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TMEM258P61165 TMX4-201ENST00000246024 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TMEM258P61165 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TMEM258P61165 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
TMEM258P61165 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
TMEM258P61165 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TMEM258P61165 MYLK-202ENST00000354792 7531 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
TMEM258P61165 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TMEM258P61165 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
TMEM258P61165 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TMEM258P61165 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TMEM258P61165 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
TMEM258P61165 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
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TMEM258P61165 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
TMEM258P61165 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TMEM258P61165 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
TMEM258P61165 SUCO-202ENST00000367723 5916 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TMEM258P61165 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TMEM258P61165 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TMEM258P61165 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
TMEM258P61165 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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TMEM258P61165 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
TMEM258P61165 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
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TMEM258P61165 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
TMEM258P61165 TCF4-248ENST00000616053 8140 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
TMEM258P61165 BMT2-201ENST00000297145 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
TMEM258P61165 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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TMEM258P61165 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
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TMEM258P61165 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
TMEM258P61165 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
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TMEM258P61165 SMC5-201ENST00000361138 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
TMEM258P61165 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
TMEM258P61165 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
TMEM258P61165 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
TMEM258P61165 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
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TMEM258P61165 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
TMEM258P61165 A1CF-202ENST00000373993 1997 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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TMEM258P61165 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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TMEM258P61165 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
TMEM258P61165 TNNI1-202ENST00000361379 5413 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
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TMEM258P61165 SPECC1L-ADORA2A-201ENST00000358654 6204 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
TMEM258P61165 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
TMEM258P61165 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
TMEM258P61165 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
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TMEM258P61165 ZMYM3-204ENST00000373982 1867 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
TMEM258P61165 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
TMEM258P61165 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
TMEM258P61165 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
TMEM258P61165 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
TMEM258P61165 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
TMEM258P61165 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
TMEM258P61165 CACNA1C-209ENST00000399603 7377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
TMEM258P61165 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
TMEM258P61165 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
TMEM258P61165 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
TMEM258P61165 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
TMEM258P61165 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
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