Protein–RNA interactions for Protein: P59074

CHMP4BP1, Putative charged multivesicular body protein 4B-like protein CHMP4BP1, humanhuman

Predictions only

Length 171 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP4BP1P59074 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHMP4BP1P59074 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHMP4BP1P59074 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHMP4BP1P59074 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHMP4BP1P59074 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHMP4BP1P59074 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHMP4BP1P59074 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHMP4BP1P59074 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHMP4BP1P59074 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHMP4BP1P59074 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHMP4BP1P59074 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHMP4BP1P59074 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHMP4BP1P59074 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHMP4BP1P59074 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHMP4BP1P59074 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHMP4BP1P59074 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHMP4BP1P59074 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHMP4BP1P59074 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHMP4BP1P59074 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHMP4BP1P59074 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHMP4BP1P59074 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHMP4BP1P59074 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CHMP4BP1P59074 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHMP4BP1P59074 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHMP4BP1P59074 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHMP4BP1P59074 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHMP4BP1P59074 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHMP4BP1P59074 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CHMP4BP1P59074 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHMP4BP1P59074 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHMP4BP1P59074 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHMP4BP1P59074 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHMP4BP1P59074 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHMP4BP1P59074 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHMP4BP1P59074 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHMP4BP1P59074 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHMP4BP1P59074 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHMP4BP1P59074 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHMP4BP1P59074 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHMP4BP1P59074 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHMP4BP1P59074 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHMP4BP1P59074 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHMP4BP1P59074 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHMP4BP1P59074 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHMP4BP1P59074 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHMP4BP1P59074 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHMP4BP1P59074 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHMP4BP1P59074 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHMP4BP1P59074 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHMP4BP1P59074 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHMP4BP1P59074 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHMP4BP1P59074 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHMP4BP1P59074 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHMP4BP1P59074 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CHMP4BP1P59074 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHMP4BP1P59074 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHMP4BP1P59074 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHMP4BP1P59074 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHMP4BP1P59074 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHMP4BP1P59074 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CHMP4BP1P59074 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHMP4BP1P59074 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHMP4BP1P59074 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHMP4BP1P59074 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHMP4BP1P59074 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHMP4BP1P59074 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHMP4BP1P59074 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CHMP4BP1P59074 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CHMP4BP1P59074 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CHMP4BP1P59074 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CHMP4BP1P59074 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CHMP4BP1P59074 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CHMP4BP1P59074 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CHMP4BP1P59074 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CHMP4BP1P59074 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CHMP4BP1P59074 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CHMP4BP1P59074 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CHMP4BP1P59074 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CHMP4BP1P59074 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CHMP4BP1P59074 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CHMP4BP1P59074 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CHMP4BP1P59074 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CHMP4BP1P59074 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CHMP4BP1P59074 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CHMP4BP1P59074 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CHMP4BP1P59074 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CHMP4BP1P59074 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CHMP4BP1P59074 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CHMP4BP1P59074 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CHMP4BP1P59074 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CHMP4BP1P59074 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CHMP4BP1P59074 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CHMP4BP1P59074 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CHMP4BP1P59074 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CHMP4BP1P59074 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CHMP4BP1P59074 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CHMP4BP1P59074 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CHMP4BP1P59074 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CHMP4BP1P59074 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CHMP4BP1P59074 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms