Protein–RNA interactions for Protein: P58499

FAM3B, Protein FAM3B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3BP58499 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
FAM3BP58499 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
FAM3BP58499 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
FAM3BP58499 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
FAM3BP58499 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
FAM3BP58499 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
FAM3BP58499 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
FAM3BP58499 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
FAM3BP58499 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
FAM3BP58499 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
FAM3BP58499 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
FAM3BP58499 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
FAM3BP58499 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
FAM3BP58499 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
FAM3BP58499 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
FAM3BP58499 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
FAM3BP58499 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
FAM3BP58499 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
FAM3BP58499 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
FAM3BP58499 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
FAM3BP58499 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
FAM3BP58499 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
FAM3BP58499 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC13.99□□□□□ -0.17
FAM3BP58499 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
FAM3BP58499 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
FAM3BP58499 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
FAM3BP58499 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
FAM3BP58499 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
FAM3BP58499 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
FAM3BP58499 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
FAM3BP58499 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
FAM3BP58499 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
FAM3BP58499 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
FAM3BP58499 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
FAM3BP58499 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
FAM3BP58499 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
FAM3BP58499 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
FAM3BP58499 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
FAM3BP58499 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
FAM3BP58499 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
FAM3BP58499 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
FAM3BP58499 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
FAM3BP58499 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
FAM3BP58499 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
FAM3BP58499 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
FAM3BP58499 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
FAM3BP58499 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
FAM3BP58499 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.98□□□□□ -0.17
FAM3BP58499 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
FAM3BP58499 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
FAM3BP58499 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
FAM3BP58499 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
FAM3BP58499 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
FAM3BP58499 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
FAM3BP58499 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
FAM3BP58499 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
FAM3BP58499 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
FAM3BP58499 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
FAM3BP58499 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
FAM3BP58499 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
FAM3BP58499 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
FAM3BP58499 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
FAM3BP58499 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
FAM3BP58499 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
FAM3BP58499 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
FAM3BP58499 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
FAM3BP58499 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
FAM3BP58499 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
FAM3BP58499 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
FAM3BP58499 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
FAM3BP58499 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
FAM3BP58499 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
FAM3BP58499 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
FAM3BP58499 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
FAM3BP58499 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
FAM3BP58499 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
FAM3BP58499 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
FAM3BP58499 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
FAM3BP58499 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
FAM3BP58499 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
FAM3BP58499 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
FAM3BP58499 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
FAM3BP58499 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
FAM3BP58499 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
FAM3BP58499 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
FAM3BP58499 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
FAM3BP58499 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
FAM3BP58499 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
FAM3BP58499 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
FAM3BP58499 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
FAM3BP58499 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
FAM3BP58499 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
FAM3BP58499 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
FAM3BP58499 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
FAM3BP58499 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
FAM3BP58499 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
FAM3BP58499 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
FAM3BP58499 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
FAM3BP58499 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
FAM3BP58499 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms