Protein–RNA interactions for Protein: P55210

CASP7, Caspase-7, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP7P55210 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CASP7P55210 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CASP7P55210 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CASP7P55210 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CASP7P55210 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CASP7P55210 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CASP7P55210 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CASP7P55210 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CASP7P55210 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CASP7P55210 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CASP7P55210 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CASP7P55210 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CASP7P55210 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CASP7P55210 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CASP7P55210 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CASP7P55210 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CASP7P55210 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CASP7P55210 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CASP7P55210 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CASP7P55210 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CASP7P55210 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CASP7P55210 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CASP7P55210 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CASP7P55210 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CASP7P55210 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CASP7P55210 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CASP7P55210 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CASP7P55210 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CASP7P55210 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CASP7P55210 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CASP7P55210 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CASP7P55210 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CASP7P55210 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CASP7P55210 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CASP7P55210 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CASP7P55210 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CASP7P55210 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CASP7P55210 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CASP7P55210 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CASP7P55210 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CASP7P55210 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CASP7P55210 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CASP7P55210 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CASP7P55210 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CASP7P55210 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CASP7P55210 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CASP7P55210 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CASP7P55210 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CASP7P55210 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CASP7P55210 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CASP7P55210 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CASP7P55210 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CASP7P55210 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CASP7P55210 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CASP7P55210 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CASP7P55210 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CASP7P55210 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CASP7P55210 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CASP7P55210 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CASP7P55210 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CASP7P55210 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CASP7P55210 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CASP7P55210 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CASP7P55210 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CASP7P55210 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CASP7P55210 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CASP7P55210 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CASP7P55210 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CASP7P55210 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CASP7P55210 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CASP7P55210 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CASP7P55210 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CASP7P55210 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CASP7P55210 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CASP7P55210 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CASP7P55210 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CASP7P55210 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CASP7P55210 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CASP7P55210 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CASP7P55210 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CASP7P55210 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CASP7P55210 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CASP7P55210 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CASP7P55210 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CASP7P55210 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CASP7P55210 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CASP7P55210 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CASP7P55210 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CASP7P55210 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CASP7P55210 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CASP7P55210 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CASP7P55210 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CASP7P55210 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CASP7P55210 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CASP7P55210 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CASP7P55210 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CASP7P55210 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CASP7P55210 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CASP7P55210 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CASP7P55210 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms