Protein–RNA interactions for Protein: P48651

PTDSS1, Phosphatidylserine synthase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTDSS1P48651 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTDSS1P48651 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTDSS1P48651 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
PTDSS1P48651 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTDSS1P48651 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTDSS1P48651 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTDSS1P48651 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTDSS1P48651 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTDSS1P48651 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PTDSS1P48651 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PTDSS1P48651 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PTDSS1P48651 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PTDSS1P48651 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PTDSS1P48651 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PTDSS1P48651 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PTDSS1P48651 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PTDSS1P48651 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PTDSS1P48651 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PTDSS1P48651 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PTDSS1P48651 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PTDSS1P48651 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PTDSS1P48651 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PTDSS1P48651 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PTDSS1P48651 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PTDSS1P48651 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PTDSS1P48651 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PTDSS1P48651 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
PTDSS1P48651 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PTDSS1P48651 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PTDSS1P48651 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PTDSS1P48651 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PTDSS1P48651 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
PTDSS1P48651 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
PTDSS1P48651 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.35
PTDSS1P48651 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
PTDSS1P48651 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PTDSS1P48651 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
PTDSS1P48651 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PTDSS1P48651 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
PTDSS1P48651 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
PTDSS1P48651 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
PTDSS1P48651 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PTDSS1P48651 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
PTDSS1P48651 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
PTDSS1P48651 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PTDSS1P48651 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
PTDSS1P48651 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
PTDSS1P48651 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
PTDSS1P48651 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
PTDSS1P48651 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTDSS1P48651 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
PTDSS1P48651 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTDSS1P48651 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTDSS1P48651 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTDSS1P48651 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTDSS1P48651 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTDSS1P48651 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTDSS1P48651 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTDSS1P48651 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
PTDSS1P48651 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTDSS1P48651 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTDSS1P48651 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTDSS1P48651 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTDSS1P48651 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTDSS1P48651 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
PTDSS1P48651 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTDSS1P48651 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTDSS1P48651 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTDSS1P48651 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTDSS1P48651 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTDSS1P48651 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTDSS1P48651 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTDSS1P48651 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTDSS1P48651 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTDSS1P48651 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTDSS1P48651 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTDSS1P48651 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTDSS1P48651 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTDSS1P48651 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTDSS1P48651 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTDSS1P48651 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTDSS1P48651 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTDSS1P48651 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTDSS1P48651 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTDSS1P48651 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTDSS1P48651 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTDSS1P48651 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTDSS1P48651 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTDSS1P48651 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTDSS1P48651 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTDSS1P48651 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTDSS1P48651 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTDSS1P48651 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTDSS1P48651 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTDSS1P48651 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTDSS1P48651 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTDSS1P48651 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
PTDSS1P48651 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTDSS1P48651 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTDSS1P48651 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms