Protein–RNA interactions for Protein: P42704

LRPPRC, Leucine-rich PPR motif-containing protein, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRPPRCP42704 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LRPPRCP42704 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LRPPRCP42704 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LRPPRCP42704 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
LRPPRCP42704 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LRPPRCP42704 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LRPPRCP42704 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LRPPRCP42704 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LRPPRCP42704 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LRPPRCP42704 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LRPPRCP42704 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LRPPRCP42704 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LRPPRCP42704 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
LRPPRCP42704 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
LRPPRCP42704 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
LRPPRCP42704 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LRPPRCP42704 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
LRPPRCP42704 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
LRPPRCP42704 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
LRPPRCP42704 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
LRPPRCP42704 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LRPPRCP42704 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
LRPPRCP42704 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
LRPPRCP42704 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
LRPPRCP42704 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LRPPRCP42704 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
LRPPRCP42704 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
LRPPRCP42704 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
LRPPRCP42704 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LRPPRCP42704 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LRPPRCP42704 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LRPPRCP42704 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LRPPRCP42704 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LRPPRCP42704 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LRPPRCP42704 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LRPPRCP42704 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
LRPPRCP42704 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LRPPRCP42704 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LRPPRCP42704 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
LRPPRCP42704 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LRPPRCP42704 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LRPPRCP42704 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LRPPRCP42704 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LRPPRCP42704 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LRPPRCP42704 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LRPPRCP42704 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LRPPRCP42704 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LRPPRCP42704 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LRPPRCP42704 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LRPPRCP42704 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LRPPRCP42704 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LRPPRCP42704 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
LRPPRCP42704 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LRPPRCP42704 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LRPPRCP42704 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
LRPPRCP42704 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LRPPRCP42704 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
LRPPRCP42704 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LRPPRCP42704 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LRPPRCP42704 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LRPPRCP42704 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LRPPRCP42704 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LRPPRCP42704 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LRPPRCP42704 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LRPPRCP42704 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LRPPRCP42704 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LRPPRCP42704 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LRPPRCP42704 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LRPPRCP42704 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LRPPRCP42704 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LRPPRCP42704 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LRPPRCP42704 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
LRPPRCP42704 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LRPPRCP42704 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LRPPRCP42704 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
LRPPRCP42704 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
LRPPRCP42704 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
LRPPRCP42704 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
LRPPRCP42704 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LRPPRCP42704 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
LRPPRCP42704 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
LRPPRCP42704 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
LRPPRCP42704 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
LRPPRCP42704 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
LRPPRCP42704 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
LRPPRCP42704 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LRPPRCP42704 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LRPPRCP42704 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LRPPRCP42704 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LRPPRCP42704 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LRPPRCP42704 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LRPPRCP42704 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LRPPRCP42704 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LRPPRCP42704 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LRPPRCP42704 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LRPPRCP42704 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LRPPRCP42704 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LRPPRCP42704 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LRPPRCP42704 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LRPPRCP42704 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms