Protein–RNA interactions for Protein: P30085

CMPK1, UMP-CMP kinase, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMPK1P30085 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CMPK1P30085 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CMPK1P30085 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CMPK1P30085 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CMPK1P30085 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CMPK1P30085 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CMPK1P30085 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CMPK1P30085 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CMPK1P30085 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CMPK1P30085 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CMPK1P30085 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CMPK1P30085 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CMPK1P30085 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CMPK1P30085 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CMPK1P30085 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CMPK1P30085 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CMPK1P30085 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CMPK1P30085 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CMPK1P30085 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CMPK1P30085 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CMPK1P30085 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CMPK1P30085 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CMPK1P30085 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CMPK1P30085 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CMPK1P30085 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CMPK1P30085 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CMPK1P30085 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CMPK1P30085 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CMPK1P30085 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CMPK1P30085 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CMPK1P30085 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CMPK1P30085 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CMPK1P30085 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CMPK1P30085 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CMPK1P30085 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CMPK1P30085 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CMPK1P30085 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CMPK1P30085 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CMPK1P30085 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CMPK1P30085 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CMPK1P30085 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CMPK1P30085 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CMPK1P30085 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CMPK1P30085 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CMPK1P30085 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CMPK1P30085 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CMPK1P30085 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CMPK1P30085 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CMPK1P30085 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CMPK1P30085 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CMPK1P30085 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CMPK1P30085 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CMPK1P30085 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CMPK1P30085 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CMPK1P30085 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CMPK1P30085 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CMPK1P30085 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CMPK1P30085 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CMPK1P30085 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CMPK1P30085 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CMPK1P30085 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CMPK1P30085 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CMPK1P30085 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CMPK1P30085 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CMPK1P30085 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CMPK1P30085 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CMPK1P30085 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CMPK1P30085 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CMPK1P30085 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CMPK1P30085 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CMPK1P30085 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CMPK1P30085 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CMPK1P30085 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CMPK1P30085 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CMPK1P30085 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CMPK1P30085 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CMPK1P30085 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CMPK1P30085 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CMPK1P30085 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CMPK1P30085 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CMPK1P30085 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CMPK1P30085 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CMPK1P30085 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CMPK1P30085 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CMPK1P30085 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CMPK1P30085 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CMPK1P30085 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CMPK1P30085 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CMPK1P30085 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CMPK1P30085 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CMPK1P30085 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CMPK1P30085 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CMPK1P30085 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CMPK1P30085 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CMPK1P30085 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CMPK1P30085 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CMPK1P30085 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CMPK1P30085 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CMPK1P30085 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CMPK1P30085 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.4 ms