Protein–RNA interactions for Protein: P29466

CASP1, Caspase-1, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP1P29466 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CASP1P29466 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CASP1P29466 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CASP1P29466 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CASP1P29466 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CASP1P29466 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CASP1P29466 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CASP1P29466 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CASP1P29466 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CASP1P29466 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CASP1P29466 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CASP1P29466 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CASP1P29466 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CASP1P29466 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CASP1P29466 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CASP1P29466 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CASP1P29466 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CASP1P29466 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CASP1P29466 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CASP1P29466 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CASP1P29466 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
CASP1P29466 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CASP1P29466 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CASP1P29466 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CASP1P29466 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CASP1P29466 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
CASP1P29466 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CASP1P29466 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CASP1P29466 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CASP1P29466 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CASP1P29466 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CASP1P29466 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CASP1P29466 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CASP1P29466 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
CASP1P29466 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CASP1P29466 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CASP1P29466 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CASP1P29466 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CASP1P29466 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CASP1P29466 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CASP1P29466 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CASP1P29466 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CASP1P29466 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CASP1P29466 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CASP1P29466 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CASP1P29466 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CASP1P29466 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CASP1P29466 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CASP1P29466 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CASP1P29466 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CASP1P29466 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CASP1P29466 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CASP1P29466 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CASP1P29466 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CASP1P29466 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CASP1P29466 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CASP1P29466 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CASP1P29466 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CASP1P29466 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CASP1P29466 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
CASP1P29466 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC20■□□□□ 0.79
CASP1P29466 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CASP1P29466 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CASP1P29466 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CASP1P29466 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CASP1P29466 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CASP1P29466 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CASP1P29466 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CASP1P29466 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CASP1P29466 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CASP1P29466 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CASP1P29466 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CASP1P29466 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
CASP1P29466 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
CASP1P29466 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
CASP1P29466 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC20■□□□□ 0.79
CASP1P29466 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
CASP1P29466 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
CASP1P29466 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC20■□□□□ 0.79
CASP1P29466 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
CASP1P29466 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CASP1P29466 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CASP1P29466 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CASP1P29466 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CASP1P29466 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CASP1P29466 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
CASP1P29466 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CASP1P29466 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CASP1P29466 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CASP1P29466 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CASP1P29466 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CASP1P29466 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CASP1P29466 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CASP1P29466 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CASP1P29466 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CASP1P29466 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CASP1P29466 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CASP1P29466 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CASP1P29466 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CASP1P29466 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms