Protein–RNA interactions for Protein: P28676

GCA, Grancalcin, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCAP28676 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GCAP28676 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GCAP28676 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GCAP28676 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GCAP28676 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GCAP28676 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GCAP28676 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GCAP28676 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GCAP28676 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GCAP28676 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GCAP28676 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GCAP28676 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GCAP28676 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GCAP28676 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GCAP28676 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GCAP28676 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GCAP28676 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GCAP28676 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GCAP28676 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GCAP28676 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
GCAP28676 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GCAP28676 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GCAP28676 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GCAP28676 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GCAP28676 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
GCAP28676 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GCAP28676 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
GCAP28676 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
GCAP28676 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
GCAP28676 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
GCAP28676 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GCAP28676 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GCAP28676 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GCAP28676 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GCAP28676 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GCAP28676 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GCAP28676 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GCAP28676 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GCAP28676 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GCAP28676 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GCAP28676 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GCAP28676 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GCAP28676 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GCAP28676 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GCAP28676 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GCAP28676 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GCAP28676 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
GCAP28676 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GCAP28676 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GCAP28676 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GCAP28676 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GCAP28676 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GCAP28676 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GCAP28676 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GCAP28676 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GCAP28676 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GCAP28676 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GCAP28676 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GCAP28676 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GCAP28676 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
GCAP28676 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
GCAP28676 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
GCAP28676 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GCAP28676 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GCAP28676 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GCAP28676 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GCAP28676 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
GCAP28676 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GCAP28676 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GCAP28676 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GCAP28676 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GCAP28676 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GCAP28676 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GCAP28676 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GCAP28676 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GCAP28676 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GCAP28676 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GCAP28676 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GCAP28676 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GCAP28676 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GCAP28676 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
GCAP28676 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GCAP28676 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GCAP28676 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GCAP28676 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GCAP28676 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GCAP28676 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GCAP28676 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GCAP28676 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GCAP28676 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GCAP28676 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GCAP28676 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GCAP28676 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GCAP28676 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GCAP28676 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GCAP28676 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GCAP28676 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GCAP28676 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
GCAP28676 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GCAP28676 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms