Protein–RNA interactions for Protein: P20851

C4BPB, C4b-binding protein beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4BPBP20851 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C4BPBP20851 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C4BPBP20851 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C4BPBP20851 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C4BPBP20851 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C4BPBP20851 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C4BPBP20851 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C4BPBP20851 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C4BPBP20851 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C4BPBP20851 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C4BPBP20851 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C4BPBP20851 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C4BPBP20851 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C4BPBP20851 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C4BPBP20851 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C4BPBP20851 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C4BPBP20851 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C4BPBP20851 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C4BPBP20851 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C4BPBP20851 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C4BPBP20851 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C4BPBP20851 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C4BPBP20851 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
C4BPBP20851 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C4BPBP20851 ROCK1-201ENST00000399799 9484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C4BPBP20851 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C4BPBP20851 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
C4BPBP20851 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
C4BPBP20851 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C4BPBP20851 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C4BPBP20851 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
C4BPBP20851 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
C4BPBP20851 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
C4BPBP20851 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
C4BPBP20851 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
C4BPBP20851 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
C4BPBP20851 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
C4BPBP20851 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
C4BPBP20851 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
C4BPBP20851 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C4BPBP20851 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C4BPBP20851 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C4BPBP20851 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C4BPBP20851 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C4BPBP20851 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C4BPBP20851 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C4BPBP20851 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C4BPBP20851 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C4BPBP20851 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C4BPBP20851 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C4BPBP20851 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C4BPBP20851 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
C4BPBP20851 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C4BPBP20851 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C4BPBP20851 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C4BPBP20851 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C4BPBP20851 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
C4BPBP20851 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
C4BPBP20851 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
C4BPBP20851 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
C4BPBP20851 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C4BPBP20851 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C4BPBP20851 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C4BPBP20851 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C4BPBP20851 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C4BPBP20851 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C4BPBP20851 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C4BPBP20851 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C4BPBP20851 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C4BPBP20851 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C4BPBP20851 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C4BPBP20851 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C4BPBP20851 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C4BPBP20851 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C4BPBP20851 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C4BPBP20851 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C4BPBP20851 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C4BPBP20851 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C4BPBP20851 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C4BPBP20851 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C4BPBP20851 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C4BPBP20851 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C4BPBP20851 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C4BPBP20851 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C4BPBP20851 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C4BPBP20851 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C4BPBP20851 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C4BPBP20851 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C4BPBP20851 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C4BPBP20851 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C4BPBP20851 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C4BPBP20851 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C4BPBP20851 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C4BPBP20851 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C4BPBP20851 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C4BPBP20851 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C4BPBP20851 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
C4BPBP20851 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C4BPBP20851 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C4BPBP20851 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms