Protein–RNA interactions for Protein: P19876

CXCL3, C-X-C motif chemokine 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL3P19876 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CXCL3P19876 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CXCL3P19876 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CXCL3P19876 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CXCL3P19876 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CXCL3P19876 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CXCL3P19876 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CXCL3P19876 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CXCL3P19876 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CXCL3P19876 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CXCL3P19876 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CXCL3P19876 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
CXCL3P19876 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CXCL3P19876 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CXCL3P19876 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CXCL3P19876 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CXCL3P19876 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CXCL3P19876 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CXCL3P19876 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CXCL3P19876 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CXCL3P19876 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CXCL3P19876 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CXCL3P19876 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CXCL3P19876 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CXCL3P19876 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CXCL3P19876 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CXCL3P19876 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CXCL3P19876 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CXCL3P19876 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CXCL3P19876 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CXCL3P19876 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CXCL3P19876 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CXCL3P19876 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CXCL3P19876 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CXCL3P19876 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CXCL3P19876 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CXCL3P19876 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CXCL3P19876 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CXCL3P19876 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CXCL3P19876 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CXCL3P19876 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CXCL3P19876 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
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CXCL3P19876 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CXCL3P19876 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CXCL3P19876 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CXCL3P19876 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CXCL3P19876 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC15.03■□□□□ -0
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CXCL3P19876 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CXCL3P19876 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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CXCL3P19876 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CXCL3P19876 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CXCL3P19876 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CXCL3P19876 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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CXCL3P19876 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CXCL3P19876 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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CXCL3P19876 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CXCL3P19876 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
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CXCL3P19876 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
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CXCL3P19876 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CXCL3P19876 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC15.02■□□□□ -0
CXCL3P19876 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
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CXCL3P19876 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CXCL3P19876 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CXCL3P19876 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CXCL3P19876 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CXCL3P19876 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CXCL3P19876 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
CXCL3P19876 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CXCL3P19876 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CXCL3P19876 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CXCL3P19876 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CXCL3P19876 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
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