Protein–RNA interactions for Protein: P17482

HOXB9, Homeobox protein Hox-B9, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB9P17482 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXB9P17482 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXB9P17482 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXB9P17482 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXB9P17482 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXB9P17482 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXB9P17482 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXB9P17482 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXB9P17482 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXB9P17482 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXB9P17482 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXB9P17482 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXB9P17482 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXB9P17482 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXB9P17482 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXB9P17482 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXB9P17482 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXB9P17482 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXB9P17482 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXB9P17482 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXB9P17482 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXB9P17482 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXB9P17482 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXB9P17482 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXB9P17482 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXB9P17482 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXB9P17482 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXB9P17482 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXB9P17482 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXB9P17482 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXB9P17482 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXB9P17482 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXB9P17482 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXB9P17482 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXB9P17482 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXB9P17482 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXB9P17482 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXB9P17482 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXB9P17482 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXB9P17482 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXB9P17482 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXB9P17482 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXB9P17482 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXB9P17482 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXB9P17482 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXB9P17482 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXB9P17482 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXB9P17482 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
HOXB9P17482 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
HOXB9P17482 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
HOXB9P17482 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
HOXB9P17482 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
HOXB9P17482 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HOXB9P17482 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
HOXB9P17482 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HOXB9P17482 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HOXB9P17482 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HOXB9P17482 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HOXB9P17482 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HOXB9P17482 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
HOXB9P17482 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HOXB9P17482 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
HOXB9P17482 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HOXB9P17482 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HOXB9P17482 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HOXB9P17482 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HOXB9P17482 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HOXB9P17482 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HOXB9P17482 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HOXB9P17482 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HOXB9P17482 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HOXB9P17482 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HOXB9P17482 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HOXB9P17482 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HOXB9P17482 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HOXB9P17482 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HOXB9P17482 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HOXB9P17482 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HOXB9P17482 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HOXB9P17482 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HOXB9P17482 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HOXB9P17482 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HOXB9P17482 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HOXB9P17482 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HOXB9P17482 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HOXB9P17482 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HOXB9P17482 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HOXB9P17482 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HOXB9P17482 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HOXB9P17482 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HOXB9P17482 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
HOXB9P17482 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HOXB9P17482 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HOXB9P17482 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HOXB9P17482 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
HOXB9P17482 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HOXB9P17482 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HOXB9P17482 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HOXB9P17482 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HOXB9P17482 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms