Protein–RNA interactions for Protein: P17301

ITGA2, Integrin alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA2P17301 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ITGA2P17301 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ITGA2P17301 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ITGA2P17301 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ITGA2P17301 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ITGA2P17301 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ITGA2P17301 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ITGA2P17301 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ITGA2P17301 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ITGA2P17301 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ITGA2P17301 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ITGA2P17301 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ITGA2P17301 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ITGA2P17301 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ITGA2P17301 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ITGA2P17301 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ITGA2P17301 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ITGA2P17301 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ITGA2P17301 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ITGA2P17301 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ITGA2P17301 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ITGA2P17301 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
ITGA2P17301 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ITGA2P17301 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
ITGA2P17301 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
ITGA2P17301 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ITGA2P17301 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ITGA2P17301 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ITGA2P17301 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ITGA2P17301 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ITGA2P17301 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ITGA2P17301 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
ITGA2P17301 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
ITGA2P17301 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ITGA2P17301 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ITGA2P17301 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ITGA2P17301 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ITGA2P17301 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ITGA2P17301 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ITGA2P17301 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ITGA2P17301 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ITGA2P17301 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ITGA2P17301 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ITGA2P17301 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ITGA2P17301 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ITGA2P17301 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ITGA2P17301 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ITGA2P17301 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ITGA2P17301 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ITGA2P17301 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ITGA2P17301 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ITGA2P17301 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ITGA2P17301 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ITGA2P17301 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ITGA2P17301 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ITGA2P17301 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ITGA2P17301 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ITGA2P17301 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ITGA2P17301 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ITGA2P17301 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ITGA2P17301 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ITGA2P17301 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ITGA2P17301 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ITGA2P17301 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ITGA2P17301 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ITGA2P17301 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ITGA2P17301 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ITGA2P17301 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ITGA2P17301 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ITGA2P17301 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ITGA2P17301 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ITGA2P17301 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ITGA2P17301 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ITGA2P17301 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ITGA2P17301 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ITGA2P17301 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ITGA2P17301 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ITGA2P17301 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ITGA2P17301 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ITGA2P17301 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ITGA2P17301 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ITGA2P17301 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ITGA2P17301 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ITGA2P17301 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ITGA2P17301 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ITGA2P17301 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ITGA2P17301 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ITGA2P17301 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ITGA2P17301 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ITGA2P17301 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ITGA2P17301 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ITGA2P17301 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ITGA2P17301 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ITGA2P17301 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ITGA2P17301 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ITGA2P17301 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ITGA2P17301 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ITGA2P17301 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ITGA2P17301 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ITGA2P17301 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms