Protein–RNA interactions for Protein: P08648

ITGA5, Integrin alpha-5, humanhuman

Predictions only

Length 1,049 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA5P08648 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ITGA5P08648 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ITGA5P08648 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ITGA5P08648 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ITGA5P08648 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ITGA5P08648 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ITGA5P08648 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ITGA5P08648 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ITGA5P08648 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ITGA5P08648 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ITGA5P08648 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ITGA5P08648 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ITGA5P08648 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ITGA5P08648 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ITGA5P08648 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ITGA5P08648 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ITGA5P08648 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ITGA5P08648 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ITGA5P08648 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ITGA5P08648 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ITGA5P08648 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ITGA5P08648 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ITGA5P08648 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ITGA5P08648 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ITGA5P08648 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ITGA5P08648 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ITGA5P08648 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ITGA5P08648 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ITGA5P08648 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ITGA5P08648 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ITGA5P08648 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ITGA5P08648 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ITGA5P08648 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ITGA5P08648 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ITGA5P08648 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ITGA5P08648 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ITGA5P08648 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ITGA5P08648 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ITGA5P08648 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ITGA5P08648 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ITGA5P08648 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ITGA5P08648 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ITGA5P08648 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ITGA5P08648 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ITGA5P08648 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ITGA5P08648 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ITGA5P08648 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ITGA5P08648 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ITGA5P08648 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ITGA5P08648 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ITGA5P08648 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ITGA5P08648 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ITGA5P08648 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ITGA5P08648 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ITGA5P08648 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ITGA5P08648 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ITGA5P08648 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ITGA5P08648 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ITGA5P08648 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ITGA5P08648 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ITGA5P08648 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ITGA5P08648 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ITGA5P08648 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ITGA5P08648 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ITGA5P08648 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ITGA5P08648 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ITGA5P08648 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ITGA5P08648 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ITGA5P08648 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ITGA5P08648 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ITGA5P08648 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ITGA5P08648 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ITGA5P08648 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ITGA5P08648 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ITGA5P08648 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ITGA5P08648 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ITGA5P08648 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ITGA5P08648 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ITGA5P08648 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ITGA5P08648 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ITGA5P08648 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ITGA5P08648 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ITGA5P08648 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ITGA5P08648 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ITGA5P08648 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ITGA5P08648 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ITGA5P08648 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ITGA5P08648 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ITGA5P08648 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ITGA5P08648 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ITGA5P08648 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ITGA5P08648 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ITGA5P08648 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ITGA5P08648 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ITGA5P08648 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ITGA5P08648 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ITGA5P08648 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ITGA5P08648 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ITGA5P08648 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ITGA5P08648 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms