Protein–RNA interactions for Protein: P00533

EGFR, Epidermal growth factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGFRP00533 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
EGFRP00533 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
EGFRP00533 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
EGFRP00533 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
EGFRP00533 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
EGFRP00533 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
EGFRP00533 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
EGFRP00533 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
EGFRP00533 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
EGFRP00533 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
EGFRP00533 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
EGFRP00533 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
EGFRP00533 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
EGFRP00533 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
EGFRP00533 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
EGFRP00533 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
EGFRP00533 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
EGFRP00533 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
EGFRP00533 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
EGFRP00533 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
EGFRP00533 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
EGFRP00533 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
EGFRP00533 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
EGFRP00533 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
EGFRP00533 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
EGFRP00533 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
EGFRP00533 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
EGFRP00533 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
EGFRP00533 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
EGFRP00533 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
EGFRP00533 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
EGFRP00533 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
EGFRP00533 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
EGFRP00533 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
EGFRP00533 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
EGFRP00533 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
EGFRP00533 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
EGFRP00533 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
EGFRP00533 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
EGFRP00533 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
EGFRP00533 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
EGFRP00533 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
EGFRP00533 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
EGFRP00533 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
EGFRP00533 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
EGFRP00533 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
EGFRP00533 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
EGFRP00533 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
EGFRP00533 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
EGFRP00533 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
EGFRP00533 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
EGFRP00533 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
EGFRP00533 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
EGFRP00533 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
EGFRP00533 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
EGFRP00533 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
EGFRP00533 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
EGFRP00533 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
EGFRP00533 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
EGFRP00533 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
EGFRP00533 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
EGFRP00533 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
EGFRP00533 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
EGFRP00533 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
EGFRP00533 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
EGFRP00533 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
EGFRP00533 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
EGFRP00533 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
EGFRP00533 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
EGFRP00533 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
EGFRP00533 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
EGFRP00533 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
EGFRP00533 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
EGFRP00533 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
EGFRP00533 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
EGFRP00533 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
EGFRP00533 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
EGFRP00533 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
EGFRP00533 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
EGFRP00533 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
EGFRP00533 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
EGFRP00533 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
EGFRP00533 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
EGFRP00533 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
EGFRP00533 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
EGFRP00533 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
EGFRP00533 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
EGFRP00533 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
EGFRP00533 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
EGFRP00533 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
EGFRP00533 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
EGFRP00533 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
EGFRP00533 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
EGFRP00533 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
EGFRP00533 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
EGFRP00533 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
EGFRP00533 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
EGFRP00533 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
EGFRP00533 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
EGFRP00533 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms