Protein–RNA interactions for Protein: O95166

GABARAP, Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABARAPO95166 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GABARAPO95166 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GABARAPO95166 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GABARAPO95166 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GABARAPO95166 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GABARAPO95166 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GABARAPO95166 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GABARAPO95166 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GABARAPO95166 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GABARAPO95166 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GABARAPO95166 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GABARAPO95166 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GABARAPO95166 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GABARAPO95166 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GABARAPO95166 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GABARAPO95166 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GABARAPO95166 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GABARAPO95166 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GABARAPO95166 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GABARAPO95166 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GABARAPO95166 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GABARAPO95166 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GABARAPO95166 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GABARAPO95166 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GABARAPO95166 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GABARAPO95166 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GABARAPO95166 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GABARAPO95166 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GABARAPO95166 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GABARAPO95166 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GABARAPO95166 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GABARAPO95166 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GABARAPO95166 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GABARAPO95166 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GABARAPO95166 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GABARAPO95166 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GABARAPO95166 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GABARAPO95166 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GABARAPO95166 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GABARAPO95166 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GABARAPO95166 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GABARAPO95166 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GABARAPO95166 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GABARAPO95166 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GABARAPO95166 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GABARAPO95166 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
GABARAPO95166 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GABARAPO95166 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GABARAPO95166 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GABARAPO95166 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GABARAPO95166 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
GABARAPO95166 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GABARAPO95166 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GABARAPO95166 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GABARAPO95166 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GABARAPO95166 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GABARAPO95166 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GABARAPO95166 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GABARAPO95166 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GABARAPO95166 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GABARAPO95166 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GABARAPO95166 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GABARAPO95166 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
GABARAPO95166 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GABARAPO95166 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GABARAPO95166 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
GABARAPO95166 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
GABARAPO95166 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GABARAPO95166 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GABARAPO95166 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GABARAPO95166 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GABARAPO95166 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GABARAPO95166 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GABARAPO95166 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GABARAPO95166 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GABARAPO95166 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GABARAPO95166 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABARAPO95166 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABARAPO95166 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABARAPO95166 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABARAPO95166 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABARAPO95166 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABARAPO95166 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABARAPO95166 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABARAPO95166 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABARAPO95166 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABARAPO95166 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABARAPO95166 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABARAPO95166 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABARAPO95166 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABARAPO95166 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABARAPO95166 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABARAPO95166 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABARAPO95166 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABARAPO95166 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABARAPO95166 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABARAPO95166 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABARAPO95166 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABARAPO95166 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABARAPO95166 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.3 ms