Protein–RNA interactions for Protein: O75909

CCNK, Cyclin-K, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNKO75909 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCNKO75909 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCNKO75909 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCNKO75909 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCNKO75909 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCNKO75909 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCNKO75909 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCNKO75909 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCNKO75909 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCNKO75909 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCNKO75909 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCNKO75909 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCNKO75909 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCNKO75909 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCNKO75909 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCNKO75909 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCNKO75909 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCNKO75909 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCNKO75909 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCNKO75909 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CCNKO75909 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCNKO75909 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCNKO75909 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CCNKO75909 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCNKO75909 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCNKO75909 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCNKO75909 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCNKO75909 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCNKO75909 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCNKO75909 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCNKO75909 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCNKO75909 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCNKO75909 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCNKO75909 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCNKO75909 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCNKO75909 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCNKO75909 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCNKO75909 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCNKO75909 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCNKO75909 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCNKO75909 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCNKO75909 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCNKO75909 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCNKO75909 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCNKO75909 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCNKO75909 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCNKO75909 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCNKO75909 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCNKO75909 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCNKO75909 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCNKO75909 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCNKO75909 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCNKO75909 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCNKO75909 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCNKO75909 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CCNKO75909 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCNKO75909 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCNKO75909 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCNKO75909 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCNKO75909 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCNKO75909 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCNKO75909 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCNKO75909 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCNKO75909 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCNKO75909 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCNKO75909 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCNKO75909 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCNKO75909 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCNKO75909 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCNKO75909 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCNKO75909 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCNKO75909 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCNKO75909 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCNKO75909 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCNKO75909 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CCNKO75909 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CCNKO75909 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCNKO75909 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCNKO75909 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCNKO75909 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCNKO75909 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCNKO75909 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCNKO75909 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCNKO75909 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCNKO75909 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCNKO75909 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCNKO75909 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCNKO75909 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCNKO75909 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCNKO75909 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCNKO75909 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCNKO75909 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCNKO75909 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCNKO75909 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCNKO75909 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCNKO75909 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCNKO75909 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCNKO75909 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCNKO75909 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCNKO75909 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms