Protein–RNA interactions for Protein: O43927

CXCL13, C-X-C motif chemokine 13, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL13O43927 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CXCL13O43927 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CXCL13O43927 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CXCL13O43927 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CXCL13O43927 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CXCL13O43927 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CXCL13O43927 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CXCL13O43927 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CXCL13O43927 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CXCL13O43927 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CXCL13O43927 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CXCL13O43927 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CXCL13O43927 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CXCL13O43927 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CXCL13O43927 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CXCL13O43927 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CXCL13O43927 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CXCL13O43927 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CXCL13O43927 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CXCL13O43927 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CXCL13O43927 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CXCL13O43927 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CXCL13O43927 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CXCL13O43927 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CXCL13O43927 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CXCL13O43927 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CXCL13O43927 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CXCL13O43927 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CXCL13O43927 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CXCL13O43927 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CXCL13O43927 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CXCL13O43927 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CXCL13O43927 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CXCL13O43927 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CXCL13O43927 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CXCL13O43927 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CXCL13O43927 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CXCL13O43927 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CXCL13O43927 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CXCL13O43927 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CXCL13O43927 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CXCL13O43927 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CXCL13O43927 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CXCL13O43927 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CXCL13O43927 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CXCL13O43927 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CXCL13O43927 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CXCL13O43927 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CXCL13O43927 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CXCL13O43927 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CXCL13O43927 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CXCL13O43927 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CXCL13O43927 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CXCL13O43927 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CXCL13O43927 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CXCL13O43927 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CXCL13O43927 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CXCL13O43927 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CXCL13O43927 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CXCL13O43927 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CXCL13O43927 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CXCL13O43927 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CXCL13O43927 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CXCL13O43927 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CXCL13O43927 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CXCL13O43927 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CXCL13O43927 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CXCL13O43927 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CXCL13O43927 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CXCL13O43927 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CXCL13O43927 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CXCL13O43927 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CXCL13O43927 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CXCL13O43927 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CXCL13O43927 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CXCL13O43927 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CXCL13O43927 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CXCL13O43927 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CXCL13O43927 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CXCL13O43927 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CXCL13O43927 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CXCL13O43927 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CXCL13O43927 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CXCL13O43927 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CXCL13O43927 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CXCL13O43927 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CXCL13O43927 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
CXCL13O43927 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CXCL13O43927 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CXCL13O43927 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CXCL13O43927 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CXCL13O43927 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CXCL13O43927 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CXCL13O43927 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CXCL13O43927 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CXCL13O43927 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CXCL13O43927 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CXCL13O43927 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CXCL13O43927 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CXCL13O43927 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms