Protein–RNA interactions for Protein: O15160

POLR1C, DNA-directed RNA polymerases I and III subunit RPAC1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1CO15160 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
POLR1CO15160 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
POLR1CO15160 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
POLR1CO15160 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
POLR1CO15160 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
POLR1CO15160 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
POLR1CO15160 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
POLR1CO15160 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
POLR1CO15160 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
POLR1CO15160 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
POLR1CO15160 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
POLR1CO15160 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
POLR1CO15160 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
POLR1CO15160 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
POLR1CO15160 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
POLR1CO15160 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
POLR1CO15160 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
POLR1CO15160 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
POLR1CO15160 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
POLR1CO15160 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
POLR1CO15160 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
POLR1CO15160 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
POLR1CO15160 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
POLR1CO15160 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
POLR1CO15160 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
POLR1CO15160 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
POLR1CO15160 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
POLR1CO15160 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
POLR1CO15160 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
POLR1CO15160 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
POLR1CO15160 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
POLR1CO15160 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
POLR1CO15160 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
POLR1CO15160 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
POLR1CO15160 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
POLR1CO15160 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
POLR1CO15160 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
POLR1CO15160 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
POLR1CO15160 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
POLR1CO15160 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
POLR1CO15160 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
POLR1CO15160 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
POLR1CO15160 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
POLR1CO15160 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
POLR1CO15160 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
POLR1CO15160 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
POLR1CO15160 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
POLR1CO15160 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
POLR1CO15160 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
POLR1CO15160 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
POLR1CO15160 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
POLR1CO15160 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
POLR1CO15160 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
POLR1CO15160 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
POLR1CO15160 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
POLR1CO15160 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
POLR1CO15160 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
POLR1CO15160 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
POLR1CO15160 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
POLR1CO15160 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
POLR1CO15160 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
POLR1CO15160 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
POLR1CO15160 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
POLR1CO15160 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
POLR1CO15160 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
POLR1CO15160 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
POLR1CO15160 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
POLR1CO15160 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
POLR1CO15160 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
POLR1CO15160 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
POLR1CO15160 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
POLR1CO15160 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
POLR1CO15160 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
POLR1CO15160 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
POLR1CO15160 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
POLR1CO15160 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
POLR1CO15160 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
POLR1CO15160 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
POLR1CO15160 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
POLR1CO15160 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
POLR1CO15160 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
POLR1CO15160 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
POLR1CO15160 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
POLR1CO15160 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
POLR1CO15160 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
POLR1CO15160 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
POLR1CO15160 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
POLR1CO15160 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
POLR1CO15160 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
POLR1CO15160 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
POLR1CO15160 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
POLR1CO15160 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
POLR1CO15160 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
POLR1CO15160 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
POLR1CO15160 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
POLR1CO15160 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
POLR1CO15160 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
POLR1CO15160 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
POLR1CO15160 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
POLR1CO15160 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.7 ms