Protein–RNA interactions for Protein: F8W1W9

NPIPB9, Nuclear pore complex-interacting protein family member B9, humanhuman

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPB9F8W1W9 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NPIPB9F8W1W9 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NPIPB9F8W1W9 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NPIPB9F8W1W9 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NPIPB9F8W1W9 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NPIPB9F8W1W9 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NPIPB9F8W1W9 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NPIPB9F8W1W9 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NPIPB9F8W1W9 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NPIPB9F8W1W9 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NPIPB9F8W1W9 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NPIPB9F8W1W9 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NPIPB9F8W1W9 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NPIPB9F8W1W9 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NPIPB9F8W1W9 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NPIPB9F8W1W9 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NPIPB9F8W1W9 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NPIPB9F8W1W9 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NPIPB9F8W1W9 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NPIPB9F8W1W9 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NPIPB9F8W1W9 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NPIPB9F8W1W9 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NPIPB9F8W1W9 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NPIPB9F8W1W9 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NPIPB9F8W1W9 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NPIPB9F8W1W9 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NPIPB9F8W1W9 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NPIPB9F8W1W9 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NPIPB9F8W1W9 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NPIPB9F8W1W9 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NPIPB9F8W1W9 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NPIPB9F8W1W9 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NPIPB9F8W1W9 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NPIPB9F8W1W9 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NPIPB9F8W1W9 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NPIPB9F8W1W9 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NPIPB9F8W1W9 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NPIPB9F8W1W9 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NPIPB9F8W1W9 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NPIPB9F8W1W9 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NPIPB9F8W1W9 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NPIPB9F8W1W9 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NPIPB9F8W1W9 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NPIPB9F8W1W9 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NPIPB9F8W1W9 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NPIPB9F8W1W9 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NPIPB9F8W1W9 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NPIPB9F8W1W9 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NPIPB9F8W1W9 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NPIPB9F8W1W9 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NPIPB9F8W1W9 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NPIPB9F8W1W9 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NPIPB9F8W1W9 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NPIPB9F8W1W9 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NPIPB9F8W1W9 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
NPIPB9F8W1W9 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NPIPB9F8W1W9 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
NPIPB9F8W1W9 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NPIPB9F8W1W9 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NPIPB9F8W1W9 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NPIPB9F8W1W9 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NPIPB9F8W1W9 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NPIPB9F8W1W9 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NPIPB9F8W1W9 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
NPIPB9F8W1W9 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NPIPB9F8W1W9 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NPIPB9F8W1W9 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NPIPB9F8W1W9 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NPIPB9F8W1W9 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NPIPB9F8W1W9 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NPIPB9F8W1W9 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NPIPB9F8W1W9 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NPIPB9F8W1W9 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NPIPB9F8W1W9 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NPIPB9F8W1W9 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NPIPB9F8W1W9 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NPIPB9F8W1W9 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NPIPB9F8W1W9 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NPIPB9F8W1W9 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NPIPB9F8W1W9 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NPIPB9F8W1W9 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NPIPB9F8W1W9 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NPIPB9F8W1W9 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NPIPB9F8W1W9 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NPIPB9F8W1W9 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
NPIPB9F8W1W9 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NPIPB9F8W1W9 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NPIPB9F8W1W9 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
NPIPB9F8W1W9 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NPIPB9F8W1W9 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NPIPB9F8W1W9 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NPIPB9F8W1W9 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NPIPB9F8W1W9 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NPIPB9F8W1W9 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NPIPB9F8W1W9 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NPIPB9F8W1W9 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NPIPB9F8W1W9 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NPIPB9F8W1W9 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NPIPB9F8W1W9 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
NPIPB9F8W1W9 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms