Protein–RNA interactions for Protein: E9PRG8

C11orf98, Uncharacterized protein C11orf98, humanhuman

Predictions only

Length 122 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C11orf98E9PRG8 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
C11orf98E9PRG8 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
C11orf98E9PRG8 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
C11orf98E9PRG8 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
C11orf98E9PRG8 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
C11orf98E9PRG8 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
C11orf98E9PRG8 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
C11orf98E9PRG8 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
C11orf98E9PRG8 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
C11orf98E9PRG8 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
C11orf98E9PRG8 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
C11orf98E9PRG8 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
C11orf98E9PRG8 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
C11orf98E9PRG8 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
C11orf98E9PRG8 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
C11orf98E9PRG8 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
C11orf98E9PRG8 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
C11orf98E9PRG8 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
C11orf98E9PRG8 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
C11orf98E9PRG8 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
C11orf98E9PRG8 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
C11orf98E9PRG8 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
C11orf98E9PRG8 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
C11orf98E9PRG8 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
C11orf98E9PRG8 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
C11orf98E9PRG8 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
C11orf98E9PRG8 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
C11orf98E9PRG8 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
C11orf98E9PRG8 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
C11orf98E9PRG8 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
C11orf98E9PRG8 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
C11orf98E9PRG8 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
C11orf98E9PRG8 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
C11orf98E9PRG8 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
C11orf98E9PRG8 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
C11orf98E9PRG8 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
C11orf98E9PRG8 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C11orf98E9PRG8 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
C11orf98E9PRG8 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
C11orf98E9PRG8 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
C11orf98E9PRG8 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C11orf98E9PRG8 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
C11orf98E9PRG8 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C11orf98E9PRG8 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C11orf98E9PRG8 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
C11orf98E9PRG8 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C11orf98E9PRG8 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C11orf98E9PRG8 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
C11orf98E9PRG8 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
C11orf98E9PRG8 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
C11orf98E9PRG8 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C11orf98E9PRG8 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
C11orf98E9PRG8 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C11orf98E9PRG8 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
C11orf98E9PRG8 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C11orf98E9PRG8 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C11orf98E9PRG8 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C11orf98E9PRG8 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C11orf98E9PRG8 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
C11orf98E9PRG8 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C11orf98E9PRG8 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C11orf98E9PRG8 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C11orf98E9PRG8 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C11orf98E9PRG8 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C11orf98E9PRG8 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
C11orf98E9PRG8 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C11orf98E9PRG8 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
C11orf98E9PRG8 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
C11orf98E9PRG8 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C11orf98E9PRG8 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C11orf98E9PRG8 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
C11orf98E9PRG8 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C11orf98E9PRG8 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C11orf98E9PRG8 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C11orf98E9PRG8 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C11orf98E9PRG8 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C11orf98E9PRG8 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C11orf98E9PRG8 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C11orf98E9PRG8 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C11orf98E9PRG8 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
C11orf98E9PRG8 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
C11orf98E9PRG8 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C11orf98E9PRG8 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
C11orf98E9PRG8 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C11orf98E9PRG8 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
C11orf98E9PRG8 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C11orf98E9PRG8 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C11orf98E9PRG8 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
C11orf98E9PRG8 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
C11orf98E9PRG8 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C11orf98E9PRG8 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
C11orf98E9PRG8 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
C11orf98E9PRG8 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
C11orf98E9PRG8 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C11orf98E9PRG8 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
C11orf98E9PRG8 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C11orf98E9PRG8 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
C11orf98E9PRG8 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C11orf98E9PRG8 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C11orf98E9PRG8 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.4 ms