Protein–RNA interactions for Protein: C9JE40

PATL2, Protein PAT1 homolog 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PATL2C9JE40 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PATL2C9JE40 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PATL2C9JE40 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PATL2C9JE40 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PATL2C9JE40 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PATL2C9JE40 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PATL2C9JE40 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PATL2C9JE40 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PATL2C9JE40 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PATL2C9JE40 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PATL2C9JE40 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PATL2C9JE40 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PATL2C9JE40 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PATL2C9JE40 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PATL2C9JE40 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PATL2C9JE40 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PATL2C9JE40 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PATL2C9JE40 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PATL2C9JE40 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PATL2C9JE40 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PATL2C9JE40 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PATL2C9JE40 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PATL2C9JE40 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PATL2C9JE40 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PATL2C9JE40 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PATL2C9JE40 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PATL2C9JE40 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PATL2C9JE40 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PATL2C9JE40 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PATL2C9JE40 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PATL2C9JE40 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PATL2C9JE40 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PATL2C9JE40 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PATL2C9JE40 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PATL2C9JE40 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PATL2C9JE40 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PATL2C9JE40 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PATL2C9JE40 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PATL2C9JE40 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PATL2C9JE40 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PATL2C9JE40 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PATL2C9JE40 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PATL2C9JE40 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PATL2C9JE40 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PATL2C9JE40 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PATL2C9JE40 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PATL2C9JE40 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PATL2C9JE40 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PATL2C9JE40 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PATL2C9JE40 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PATL2C9JE40 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PATL2C9JE40 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PATL2C9JE40 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PATL2C9JE40 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PATL2C9JE40 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PATL2C9JE40 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PATL2C9JE40 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PATL2C9JE40 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PATL2C9JE40 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PATL2C9JE40 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PATL2C9JE40 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PATL2C9JE40 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PATL2C9JE40 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PATL2C9JE40 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PATL2C9JE40 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PATL2C9JE40 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PATL2C9JE40 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PATL2C9JE40 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PATL2C9JE40 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PATL2C9JE40 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PATL2C9JE40 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PATL2C9JE40 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PATL2C9JE40 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PATL2C9JE40 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PATL2C9JE40 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PATL2C9JE40 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PATL2C9JE40 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PATL2C9JE40 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PATL2C9JE40 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PATL2C9JE40 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PATL2C9JE40 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PATL2C9JE40 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PATL2C9JE40 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PATL2C9JE40 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PATL2C9JE40 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PATL2C9JE40 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PATL2C9JE40 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PATL2C9JE40 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PATL2C9JE40 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PATL2C9JE40 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PATL2C9JE40 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PATL2C9JE40 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PATL2C9JE40 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PATL2C9JE40 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PATL2C9JE40 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PATL2C9JE40 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PATL2C9JE40 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PATL2C9JE40 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PATL2C9JE40 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PATL2C9JE40 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms