Protein–RNA interactions for Protein: B3KS81

SRRM5, Serine/arginine repetitive matrix protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 715 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRM5B3KS81 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SRRM5B3KS81 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SRRM5B3KS81 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SRRM5B3KS81 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SRRM5B3KS81 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SRRM5B3KS81 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
SRRM5B3KS81 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SRRM5B3KS81 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SRRM5B3KS81 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SRRM5B3KS81 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SRRM5B3KS81 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SRRM5B3KS81 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SRRM5B3KS81 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SRRM5B3KS81 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SRRM5B3KS81 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SRRM5B3KS81 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SRRM5B3KS81 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SRRM5B3KS81 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SRRM5B3KS81 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SRRM5B3KS81 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SRRM5B3KS81 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SRRM5B3KS81 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SRRM5B3KS81 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SRRM5B3KS81 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SRRM5B3KS81 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SRRM5B3KS81 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SRRM5B3KS81 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SRRM5B3KS81 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SRRM5B3KS81 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SRRM5B3KS81 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SRRM5B3KS81 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SRRM5B3KS81 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SRRM5B3KS81 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SRRM5B3KS81 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SRRM5B3KS81 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SRRM5B3KS81 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SRRM5B3KS81 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SRRM5B3KS81 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SRRM5B3KS81 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SRRM5B3KS81 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SRRM5B3KS81 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SRRM5B3KS81 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SRRM5B3KS81 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SRRM5B3KS81 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SRRM5B3KS81 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SRRM5B3KS81 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SRRM5B3KS81 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SRRM5B3KS81 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SRRM5B3KS81 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SRRM5B3KS81 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SRRM5B3KS81 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SRRM5B3KS81 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SRRM5B3KS81 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SRRM5B3KS81 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SRRM5B3KS81 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SRRM5B3KS81 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SRRM5B3KS81 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SRRM5B3KS81 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SRRM5B3KS81 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SRRM5B3KS81 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SRRM5B3KS81 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SRRM5B3KS81 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SRRM5B3KS81 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SRRM5B3KS81 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SRRM5B3KS81 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SRRM5B3KS81 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SRRM5B3KS81 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SRRM5B3KS81 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SRRM5B3KS81 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SRRM5B3KS81 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SRRM5B3KS81 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SRRM5B3KS81 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SRRM5B3KS81 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC15.02■□□□□ -0
SRRM5B3KS81 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SRRM5B3KS81 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SRRM5B3KS81 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SRRM5B3KS81 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SRRM5B3KS81 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
SRRM5B3KS81 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC15.02■□□□□ -0
SRRM5B3KS81 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SRRM5B3KS81 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SRRM5B3KS81 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SRRM5B3KS81 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SRRM5B3KS81 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SRRM5B3KS81 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
SRRM5B3KS81 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SRRM5B3KS81 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
SRRM5B3KS81 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC15.02■□□□□ -0
SRRM5B3KS81 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SRRM5B3KS81 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SRRM5B3KS81 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC15.02■□□□□ -0
SRRM5B3KS81 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC15.02■□□□□ -0
SRRM5B3KS81 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SRRM5B3KS81 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SRRM5B3KS81 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC15.02■□□□□ -0
SRRM5B3KS81 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SRRM5B3KS81 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SRRM5B3KS81 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SRRM5B3KS81 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SRRM5B3KS81 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms